使用檢索式：(Actinodaphne acuminata) AND 5.8S 或者(Actinodaphne acuminata) AND internal transcr...
IP屬地：云南
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如何在NCBI下載ITS序列
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0/1型是怎么轉(zhuǎn)化的呢？
使用R語(yǔ)言對(duì)SSR數(shù)據(jù)做主成分分析（PCA）的一個(gè)簡(jiǎn)單小例子
昨天的推文介紹了使用R語(yǔ)言對(duì)比對(duì)后的DNA序列做主成分分析的一個(gè)簡(jiǎn)單小例子，推文下有朋友留言問(wèn)如何對(duì)0,1矩陣做主成分分析（PCA）查了一下參考資料找到了一個(gè)辦法 參考資料的...
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請(qǐng)問(wèn)可以出一個(gè)fastsimcoal的教程嗎？
動(dòng)物馴化及群體歷史研究
●與馴化相關(guān)的研究熱點(diǎn)主要集中在：家養(yǎng)動(dòng)物何時(shí)何地被馴化？馴化途徑是什么？馴化表型是什么？與馴化表型相關(guān)的基因有哪些？家養(yǎng)動(dòng)物馴化地點(diǎn)大致主要集中在三個(gè)地方：近東地區(qū)、中國(guó)中...
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BITE package的安裝BITE 包的安裝：BITE: BioInformatics Tools for Everyone Github地址：GitHub - marcomilanesi/BITE:...
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Rtools的安裝與配置
1.下載相對(duì)應(yīng)R版本的rtools，我的是R v4.2.1故而下載rtools為RTools42 RTools: Toolchains for building R and ...
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您好，想請(qǐng)教您關(guān)于遺傳多樣性軟件 CLUMPAK的使用，我也打不開結(jié)果鏈接
遺傳多樣性軟件 CLUMPAK 使用說(shuō)明
CLUMPAK是一個(gè)perl腳本，需要提前按照說(shuō)明書使用cpanm或conda安裝所需模塊官網(wǎng)[http://clumpak.tau.ac.il/index.html] st...
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您好，我在進(jìn)行分析時(shí)發(fā)現(xiàn)mutation rate一直都是1，但是我在準(zhǔn)備.xml文件時(shí)選定了范圍為（0，1），您知道這是什么原因嗎？
Phylogenomic_Tutorial || Bayesian Phylogenetic Inference
"Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic學(xué)習(xí)教程記錄【二】貝葉斯樹的構(gòu)建及基礎(chǔ)貝葉斯分化時(shí)間推斷" [TOC] Baye...
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命運(yùn)把你帶到那里，那你就大大方方的去
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群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因，是遺傳變異一個(gè)非常重要的來(lái)源，...
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SNP數(shù)據(jù)的AMOVA分析 和 Mantel分析一 AMOVA分析 1 將 VCF 轉(zhuǎn)換為 arp 格式，定義population PGDspider軟件 2 導(dǎo)入Alrequin 并定義group 3 starting ...
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臨床數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)可視化、機(jī)器學(xué)習(xí)、Python/R<br><br>Github：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fgithub.com%2Fjamesjin63" target="_blank">https://github.com/jamesjin63</a><br>歡迎關(guān)注我們的公眾號(hào)：EpiHub
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中國(guó)官方最新地圖下載(付源碼 2022版)前言 我們?cè)谶M(jìn)行數(shù)據(jù)可視化，或者發(fā)表文章時(shí)候，如果碰繪制中國(guó)地圖問(wèn)題，請(qǐng)記住，一定要使用中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)地圖。 但是，平時(shí)網(wǎng)上的案例，或者下載的地圖，都是缺失臺(tái)灣或者西藏交界有缺失，...
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跟著Nature Genetics學(xué)作圖：R語(yǔ)言ggplot2散點(diǎn)圖及多圖共享圖例論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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Tajima's D 繪圖
1.計(jì)算Tajima's D 通過(guò)vcftools對(duì)不同物種的Tajima'D進(jìn)行滑窗計(jì)算: vcftools --vcf str.vcf --out pop1.tajima...
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老師您好，我用easySFS的到了SFS文件（24326.84472308741 348.822624271156 283.9606422988769 303.655707038062 424.0933086521348 258.6229946524078 0 0 0 0 0），我刪除了d0和后面的0值后運(yùn)行stairway_plot，但是一直報(bào)錯(cuò)SFS error: shall have nseq-1 numbers，N+1后的0值不可以刪除嗎？
種群動(dòng)態(tài)歷史評(píng)估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）
SFS的基本理解、介紹的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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使用linux版本可解決，命令運(yùn)行
SNP數(shù)據(jù)的AMOVA分析 和 Mantel分析
一 AMOVA分析 1 將 VCF 轉(zhuǎn)換為 arp 格式，定義population PGDspider軟件 2 導(dǎo)入Alrequin 并定義group 3 starting ...
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請(qǐng)問(wèn)關(guān)于fastsimcoal2的使用和建?？梢哉?qǐng)教一下嗎？
Stairway-plot群體動(dòng)態(tài)圖
一 首先用BayesScan刪除受選擇的位點(diǎn)1.輸入文件：PGDSpider將VCF 轉(zhuǎn)為GESTE/BayScan格式，即下面的bates.xml2.運(yùn)行命令 3.輸出文...
