@自縛_a907 這些基因?qū)φw結(jié)果影響不大
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團(tuán)隊(duì)!感謝他們無私分享! 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcrip...
@自縛_a907 這些基因?qū)φw結(jié)果影響不大
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團(tuán)隊(duì)!感謝他們無私分享! 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcrip...
@自縛_a907 要按照數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的探針來轉(zhuǎn)換
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團(tuán)隊(duì)!感謝他們無私分享! 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcrip...
@自縛_a907 這個(gè)開頭的基因有印象,你去GeneCards或者NCBI檢索一下
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團(tuán)隊(duì)!感謝他們無私分享! 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcrip...
@九歌_487a 看一下前期的GEO推文
GPL16686芯片平臺(tái)分析#芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用,因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
@小熊_wh 進(jìn)去自己賬號(hào)ls -a
如何解決RStudio Server: R is taking longer to start than usualRstudio server 在運(yùn)行的時(shí)候自己斷掉了,重新登錄提示:RStudio Server: R is taking longer to start than usua...
@劉_6278 是不是哪一步參數(shù)設(shè)置不對(duì),在細(xì)致核對(duì)一下
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團(tuán)隊(duì)!感謝他們無私分享! 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcrip...
長鏈非編碼rna(lncRNAs)已經(jīng)成為多種生物過程和疾病的關(guān)鍵調(diào)控因子。雖然高通量測序使lncRNA的發(fā)現(xiàn)成為可能,但功能表征仍然有限。EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫是第一個(gè)也...
@ATing_46f7 NCBI
GPL16686芯片平臺(tái)分析#芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用,因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
@2ddc91c92d55 下載導(dǎo)入之后,簡單處理后保存的
GPL16686芯片平臺(tái)分析#芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用,因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
@我們一起舔過鐵欄桿 推文里面有介紹
四個(gè)GEO分析的萬能R包來自大神Jimmy今天想復(fù)現(xiàn)一下一篇芯片平臺(tái)為GPL17077的文章,發(fā)現(xiàn)該平臺(tái)沒有對(duì)應(yīng)的R包。按照之前的思路: 一般有三種方法可以得到芯片探針與gene的對(duì)應(yīng)關(guān)系: 金標(biāo)準(zhǔn)當(dāng)然是去基因芯片的...
@小彭要努力 我也沒有安轉(zhuǎn)包了,你百度一下吧。
細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn):從protocol到數(shù)據(jù)分析(附免費(fèi)軟件)細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn):從protocol到數(shù)據(jù)分析(附免費(fèi)軟件) 細(xì)胞周期,是指細(xì)胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結(jié)束所經(jīng)歷的全過程,分為間期與分裂期兩個(gè)階段。細(xì)胞間期又分為C0期、...
@4944c3865b86 都可以
多種批次效應(yīng)去除的方法比較-轉(zhuǎn)自生信技能樹多種批次效應(yīng)去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹 前面我在生信技能樹推文:你確定你的差異基因找對(duì)了嗎? 提出了文章的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的60個(gè)樣品并沒有按照毒品上癮與否這個(gè)表型來區(qū)分,而...
@4944c3865b86 建議整合前統(tǒng)一數(shù)據(jù)格式
多種批次效應(yīng)去除的方法比較-轉(zhuǎn)自生信技能樹多種批次效應(yīng)去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹 前面我在生信技能樹推文:你確定你的差異基因找對(duì)了嗎? 提出了文章的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的60個(gè)樣品并沒有按照毒品上癮與否這個(gè)表型來區(qū)分,而...
@九十五_4166 多了一個(gè)斜線吧
Rtools安裝避免入坑一句代碼,讓報(bào)錯(cuò)變成英文: 安裝R包報(bào)錯(cuò): 谷歌一下發(fā)現(xiàn),原來是Rtools環(huán)境變量的問題,重新安裝設(shè)置了一下Rtools 如有報(bào)錯(cuò),需要手工設(shè)置Rtools的環(huán)境變量也可以參考
簡介 在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析過程中,我們經(jīng)常會(huì)遇到不同樣本之間整合的批次效應(yīng)和細(xì)胞類型注釋的困難,projectLSI包利用term frequency–inverse docum...
@a2ddf52f4f5d 按照推文的方法應(yīng)該可以解決的
WGCNA-errorLength of 'xLabels' must equal the number of columns in 'Matrix.'Error in labeledHeatmap(Matrix = moduleTraitCor, xLabels = colnames(design), : Leng...
文章信息 文章題目:A specialized bone marrow microenvironment for fetal haematopoiesis期刊:Nature ...