@自縛_a907 這些基因?qū)φw結(jié)果影響不大
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺芯片ID轉(zhuǎn)換原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團隊！感謝他們無私分享！ 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcrip...
發(fā)簡信
IP屬地：重慶
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@自縛_a907 要按照數(shù)據(jù)對應(yīng)的探針來轉(zhuǎn)換
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺芯片ID轉(zhuǎn)換
原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團隊！感謝他們無私分享！ 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcrip...
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@自縛_a907 這個開頭的基因有印象，你去GeneCards或者NCBI檢索一下
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺芯片ID轉(zhuǎn)換
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@九歌_487a 看一下前期的GEO推文
GPL16686芯片平臺分析
＃芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用，因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
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@小熊_wh 進去自己賬號ls -a
如何解決RStudio Server: R is taking longer to start than usual
Rstudio server 在運行的時候自己斷掉了，重新登錄提示：RStudio Server: R is taking longer to start than usua...
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@劉_6278 是不是哪一步參數(shù)設(shè)置不對，在細(xì)致核對一下
GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺芯片ID轉(zhuǎn)換
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外泌體數(shù)據(jù)庫|| EVLncRNAs-V3.0版本更新：Sep 2023長鏈非編碼rna（lncRNAs）已經(jīng)成為多種生物過程和疾病的關(guān)鍵調(diào)控因子。雖然高通量測序使lncRNA的發(fā)現(xiàn)成為可能，但功能表征仍然有限。EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫是第一個也...
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@ATing_46f7 NCBI
GPL16686芯片平臺分析
＃芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用，因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
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@2ddc91c92d55 下載導(dǎo)入之后，簡單處理后保存的
GPL16686芯片平臺分析
＃芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒有現(xiàn)成的R包可以用，因此分析方法也不統(tǒng)一。見生信技能樹...
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@我們一起舔過鐵欄桿 推文里面有介紹
四個GEO分析的萬能R包來自大神Jimmy
今天想復(fù)現(xiàn)一下一篇芯片平臺為GPL17077的文章，發(fā)現(xiàn)該平臺沒有對應(yīng)的R包。按照之前的思路: 一般有三種方法可以得到芯片探針與gene的對應(yīng)關(guān)系： 金標(biāo)準(zhǔn)當(dāng)然是去基因芯片的...
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@小彭要努力 我也沒有安轉(zhuǎn)包了，你百度一下吧。
細(xì)胞周期實驗：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費軟件）
細(xì)胞周期實驗：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費軟件） 細(xì)胞周期，是指細(xì)胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結(jié)束所經(jīng)歷的全過程，分為間期與分裂期兩個階段。細(xì)胞間期又分為C0期、...
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@4944c3865b86 都可以
多種批次效應(yīng)去除的方法比較-轉(zhuǎn)自生信技能樹
多種批次效應(yīng)去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹 前面我在生信技能樹推文：你確定你的差異基因找對了嗎？ 提出了文章的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的60個樣品并沒有按照毒品上癮與否這個表型來區(qū)分，而...
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@4944c3865b86 建議整合前統(tǒng)一數(shù)據(jù)格式
多種批次效應(yīng)去除的方法比較-轉(zhuǎn)自生信技能樹
多種批次效應(yīng)去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹 前面我在生信技能樹推文：你確定你的差異基因找對了嗎？ 提出了文章的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的60個樣品并沒有按照毒品上癮與否這個表型來區(qū)分，而...
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@九十五_4166 多了一個斜線吧
Rtools安裝避免入坑
一句代碼，讓報錯變成英文： 安裝R包報錯： 谷歌一下發(fā)現(xiàn)，原來是Rtools環(huán)境變量的問題，重新安裝設(shè)置了一下Rtools 如有報錯，需要手工設(shè)置Rtools的環(huán)境變量也可以參考
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projectLSI：將你的單細(xì)胞或bulk轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)映射到參考數(shù)據(jù)集中簡介 在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析過程中，我們經(jīng)常會遇到不同樣本之間整合的批次效應(yīng)和細(xì)胞類型注釋的困難，projectLSI包利用term frequency–inverse docum...
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@a2ddf52f4f5d 按照推文的方法應(yīng)該可以解決的
WGCNA-errorLength of 'xLabels' must equal the number of columns in 'Matrix.'
Error in labeledHeatmap(Matrix = moduleTraitCor, xLabels = colnames(design), : Leng...
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胚胎期造血的特異性骨髓微環(huán)境文章信息 文章題目：A specialized bone marrow microenvironment for fetal haematopoiesis期刊：Nature ...
