About mzCloud[https://www.mzcloud.org/About] 什么是 mzCloud？ mzCloud 代表了向現(xiàn)代質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫的關(guān)鍵概念轉(zhuǎn)變 一個...
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「GO富集分析」從原理到實踐 ~ 零基礎(chǔ)掌握寫在前面 原本，我并無寫這一稿件的想法。主要原因有二： 網(wǎng)絡(luò)上已有相關(guān)資料較多，盡管類似的問題天天仍然有人問 再談起 GO富集分析，距離上次已是五六年，簡單來說，不想談 如果...
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生信log14|生信自學不求人-靠譜學習資料總結(jié)和評價生信學習資料 自學生信不求人，現(xiàn)在網(wǎng)上資料越來越豐富，但是資料多也意味著魚龍混雜，并且讓人無從選擇。正確做法應該是，找一個適合自己且完善靠譜的學習資料，從頭到尾跟一遍，代碼敲...
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生信軟件安裝神器 Mamba [conda加速器~]簡介[#toc_0] Mamba是在c++中對conda的重新實現(xiàn),可以認為是更高級的conda。有以下特點使用多線程并行下載數(shù)據(jù)和package，實現(xiàn)更高效的安裝libso...
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測序忘了發(fā)給你拼接結(jié)果？不用慌，咱們自己來！最近因為之前的測序company又菜又馬虎，忍無可忍，常換常新。在適應新公司送樣方式和測序結(jié)果等等的時候，學到了一些東西，也是今天想要分享的兩點： 1.最最常用的核酸檢測技術(shù)...
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UpSetR：集合可視化神包對于集合的可視化，第一時間想到的都是韋恩圖（venn diagram），一般集合不超過5個的時候，可視化效果還是不錯的 但是一旦數(shù)據(jù)集增加，比如說五個的時候，你就很難從圖中解...
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自定義EndNote的輸出樣式（output style）很久前的一篇文章了，喬遷新居，一定要帶過來，原文鏈接在這里自定義EndNote的輸出樣式（output style） EndNote是一種常用文獻管理軟件，由于其對Word、...
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16S rRNA 流程目錄 - qiime2
QIIME 2不僅可用于處理標記基因分析，而且 在廣泛的用戶和社區(qū)人員參與開發(fā)下，已經(jīng)產(chǎn)生了很多 可用插件 ，在未來還有更多的插件整合到QIIME 2中，它將成為適應多種微生...
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16S從實驗到數(shù)據(jù)分析最全流程文中會對遇到的問題進行解答，圖表部分也做了比較詳細的說明，對初學者比較友好，當然知道實驗部分會讓你對數(shù)據(jù)如何得來的有一個整體的把握，知其然而知其所以然，分析和解釋數(shù)據(jù)起來會更...
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ZT:微生物組學數(shù)據(jù)分析工具綜述 | 16S+宏基因組＋宏病毒組＋宏轉(zhuǎn)錄組本文轉(zhuǎn)自：生信者言 建立在高通量測序基礎(chǔ)上的微生物群落研究，當前主要有三大類：基于16S/18S/ITS等擴增子做物種分類的Metataxanomics、鳥槍法打斷全基因組D...
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R科研繪圖調(diào)色板—ggsci
ggsci是R中的一個包，提供了一系列顏色給ggplot2調(diào)色。里面包括了一些知名雜志期刊或者軟件（甚至是知名科幻電影、動畫等）的經(jīng)典配色風格，對于科研繪圖是相當有幫助的。下...
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：從OTU table到marker物種筆記內(nèi)容：由二代測序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（.fastq）到OTU table， 距離矩陣，物種多樣性指數(shù)，序列的進化樹及物種注釋信息的可分析數(shù)據(jù)，為常規(guī)分析流程?？梢允褂胾sear...
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感覺g題有點問題 是不是應該把dep_delay改成dep_time？
[14] 《R數(shù)據(jù)科學》dplyr練習
（1）找出滿足以下條件的所有航班。 a.到達時間延誤2小時或更多的航班 b.飛往休斯頓(IAH 或 HOU機場)的航班，2種方式： c.由 United, American,...
