Prokka 的使用 Prokka可以對(duì)原核基因組和宏基因組進(jìn)行快速的功能注釋。 參考資料： http://blog.sciencenet.cn/blog-3334560-1...
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[基因組工具]Prokka的使用
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宏基因組數(shù)據(jù)分析流程代碼熊金波實(shí)驗(yàn)室出品 整理歸納：Larry 本次學(xué)習(xí)使用的服務(wù)器IP地址和其用戶名賬戶密碼如下： 地址：gs0.genek.tv 用戶名：u3276 密碼：genek.tv（建議...
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mSystems | 大規(guī)模宏基因組組裝揭示了新的動(dòng)物相關(guān)微生物基因組、生物合成基因簇和其他遺傳多樣性文獻(xiàn)信息： 標(biāo)題：Large-Scale Metagenome Assembly Reveals Novel Animal-Associated Microbial Geno...
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宏基因組分箱(Binning)技術(shù)導(dǎo)讀 宏基因組分箱（Binning）是將宏基因組測(cè)序得到的混合了不同生物的序列或序列組裝得到的contigs按物種分開(kāi)歸類的過(guò)程，類似下圖[1]。傳統(tǒng)的單物種全基因組序列都是...
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8個(gè)樣本發(fā)9分PNAS：宏轉(zhuǎn)錄組 PK 宏基因組導(dǎo)讀 這篇文章僅僅納入了8個(gè)檢測(cè)對(duì)象，但是作者用這屈指可數(shù)的樣本不僅分析了冷凍、乙醇、RNAlater三種保存方法對(duì)標(biāo)本的微生物群組成、宏基因組和宏轉(zhuǎn)錄組的影響，還分析了口腔...
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宏基因組基礎(chǔ)知識(shí)
宏基因組(metagenomics) 宏基因組學(xué)（Metagenomics）也稱為元基因組學(xué)，是以樣品中的微生物群落作為整體進(jìn)行研究的學(xué)科。自然界中約有99%的微生物是不能在...
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利用ggcor包繪制相關(guān)性組合圖及環(huán)狀熱圖ggcor包最初是因?yàn)槟芸焖賹?shí)現(xiàn)19年Science一組合相關(guān)性圖(上圖所示)變得流行起來(lái)，除此該包對(duì)熱圖、熱圖等等的可視化都是很方便快捷的，除了之前介紹過(guò)的幾種相關(guān)性圖幾種...
