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Nature | 肝癌免疫微環(huán)境亞型和中性粒細胞異質性免疫微環(huán)境的異質性是腫瘤耐藥、復發(fā)和預后差的重要原因之一[1-3]。近年來，免疫治療及聯(lián)合治療給晚期腫瘤患者帶來希望，系統(tǒng)探究腫瘤免疫微環(huán)境的異質性對于治療選擇、療效預測、方...
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單細胞marker整理
##20220423 ESCC_marker plasma： IGHG3、IGHG1、MZB1 JCHAIN B： CD79A、MS4A1、IGHM、CD19、CD79A、C...
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TCGA 數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn) —— GSVA、ssGSEA 和單基因富集分析前言 前面，我們介紹過了差異基因的功能富集分析，今天，我們對這部分的內容作一些補充 主要介紹一下 GEVA、ssGSEA 和單基因的富集分析 GSVA 我們知道，GSEA 富...
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R繪圖應用實例：成組的t檢驗及繪圖本文主要是利用日常實驗數(shù)據(jù)，嘗試用R繪制與Graphpad一樣的線條圖和柱狀圖。 實驗數(shù)據(jù)：采用RNAi技術干擾ago1和dcr1兩個基因，然后熒光定量檢測干擾效果，計算出相...
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ArchR官網(wǎng)教程學習筆記16（下）:ArchR的軌跡推斷分析系列回顧：ArchR官網(wǎng)教程學習筆記1：Getting Started with ArchR[http://www.itdecent.cn/p/a2bcdfb77961]A...
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scRNAseq || 堆疊小提琴圖(StackedVlnPlot)的4種實現(xiàn)方式??最近一直在學習單細胞方面的知識，無意中看到別人的帖子在分享如何畫堆疊的小提琴圖(StackedVlnPlot)，順便就學習了一下。發(fā)現(xiàn)StackedVlnPlot圖確實看...
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如何解決注冊Google賬號手機驗證不通過的問題很多人不知道如何用中國手機號注冊谷歌賬號，注冊谷歌賬號手機號碼提示不可用，注冊谷歌賬戶時最后一步驗證賬戶輸入手機號說此電話號碼無法用于進行驗證如何解決？ 輕松三步走注冊Goo...
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Linux - top命令Linux - top命令 ps 命令可以一次性給出當前系統(tǒng)中進程狀態(tài)，但使用此方式得到的信息缺乏時效性，并且，如果管理員需要實時監(jiān)控進程運行情況，就必須不停地執(zhí)行 ps 命...
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ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓練（四）
homer軟件來尋找motif 下載數(shù)據(jù)庫 運行homer軟件 homer軟件找motif整合了兩個方法，包括依賴于數(shù)據(jù)庫的查詢，和de novo的推斷,都是讀取ChIP-s...
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你好，請問你跑完之后是如何進行可視化的呢？
使用pyscenic進行單細胞調控子計算
注：pyscenic發(fā)表在Nature protocol上，題為：A scalable SCENIC workflow for single-cell gene regula...
