寫在前面 前述，寫了一個(gè)推文，大體是《即日起「TBtools」關(guān)閉「高速插件商店」，讓往事隨風(fēng)~》。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)，舍去了兩個(gè)輔助插件安裝的插件，因?yàn)闀r(shí)代已經(jīng)不需要他們。我們選擇了...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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「TBtools」與「用戶」讓所有人掌握基因差異表達(dá)分析，共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，相關(guān)系數(shù)分析... -
PPI | 一鍵預(yù)測(cè)基因/蛋白互作網(wǎng)絡(luò)三年過去，我們更新了至少300個(gè)版本，盡管現(xiàn)在標(biāo)簽只是 TBtools v1.110。今天除夕，給大伙送一個(gè)新春大禮包，TBtools 主程序新功能，「PPI Predict...
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隨筆 | 最麻煩的不是不想干，而是想干卻不知對(duì)與錯(cuò)
過去兩周時(shí)間，卡在一個(gè)小分析項(xiàng)目上，過得不太好。原因簡(jiǎn)單，在我的認(rèn)知里相關(guān)分析就是跑一兩行命令就完事了。原本是交給本科生去干，當(dāng)然本科生可能太忙了，于是交給碩士去干。給了方法...
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一文嘗試解決水稻參考基因組下載
昨天發(fā)了如何一步下載水稻泛基因組的contig序列，就有小伙伴在后臺(tái)問我如何下載水稻最新版日本晴參考基因組序列。由于我主要是研究擬南芥(Arabidopsis thalian...
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任何人！十分鐘掌握Circos圖繪制
寫在寫在前面的前面 我不喜歡調(diào)用外部程序，如果是簡(jiǎn)單的事情。我覺得應(yīng)該用最簡(jiǎn)單的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)。如果你只是想畫一個(gè)簡(jiǎn)單的Circos圖，perl？不用的。R？不用的。網(wǎng)頁(yè)？不用的...
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基因選擇壓力分析 | Ka/Ks, Dn/Ds 大規(guī)模計(jì)算，更快更準(zhǔn)！寫在前面 來(lái)來(lái)去去，這個(gè)主題相關(guān)的，我已經(jīng)寫過很多個(gè)推文，甚至還包括與Raindy（福建農(nóng)林高芳鑾老師）合作開發(fā)和發(fā)表了 EasyCodeML。只能說(shuō)，確實(shí)是一個(gè)相對(duì)常見但似...
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植物啟動(dòng)子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測(cè)-可視化分析寫在前面 以前總看到問題是，基因結(jié)構(gòu)可視化的問題；現(xiàn)在則變成了啟動(dòng)子元件的預(yù)測(cè)或者說(shuō)可視化。這本身比較簡(jiǎn)單，也比較玄乎，所以我一直不是太樂意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng)，手上的...
