這次是分享李婧翌團(tuán)隊(duì)的一篇綜述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
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從統(tǒng)計(jì)學(xué)的角度理解RNA-seq -
Python爬蟲獲取geneID對應(yīng)的NCBI注釋在海量的組學(xué)數(shù)據(jù)中，我們經(jīng)常需要根據(jù)已有的差異表達(dá)基因找到對應(yīng)的注釋信息。那么針對一系列基因ID批量獲取其注釋無疑能夠大大簡化后繼的分析，提高科研效率。本次來分享使用pyth...
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R語言ggplot2做柱形圖展示富集分析的結(jié)果做完轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)或者其他的一些分析拿到一些基因名稱之后下一步通常是做一些注釋，比如GO或者KEGG的注釋，注釋好以后通常是富集分析。如果是研究比較多的物種，可以直接使用R語...
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K均值聚類算法會將數(shù)據(jù)集分為 K 個簇，每個簇使用簇內(nèi)所有樣本均值來表示，將該均值稱為“質(zhì)心”距離計(jì)算方式是 歐式距離 a.從樣本中選擇 K 個點(diǎn)作為初始質(zhì)心（完全隨機(jī)）b.計(jì)算每個樣...
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每周文獻(xiàn) 2022-03-20大家好，本周給大家分享的是最近發(fā)表在NG上與稀有變異對復(fù)雜性狀遺傳力的貢獻(xiàn)相關(guān)的一篇文章。 文章題目：Assessing the contribution of rare v...
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PopSizeABC：一百萬年至今的種群歷史模擬 demographic historyPopSizeABC的原理：1.根據(jù)觀測數(shù)據(jù)（真實(shí)數(shù)據(jù)）估算SFS和LD2.考慮了大量隨機(jī)種群歷史變化情景。對于每個歷史變化情景，都會模擬許多序列。這些序列可以反映相應(yīng)的歷史...
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聊一些鮮為人知但有趣的Python特性，附案例Python其實(shí)是難搞的 之前有個小學(xué)弟畢業(yè)論文用到Python做NLP，學(xué)了半個月跟我說Python真的太良心了，語法相對Java簡潔很多，我笑了笑說那是你用的太少，沒遭遇...
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盤點(diǎn)最重要的7個Python庫推薦：Python全棧教程！花了29980買的從入門到精通課程，分享給大家[https://www.bilibili.com/video/BV1YZ4y197RY] 01 N...
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關(guān)于測序數(shù)據(jù)大小的問題
基本概念我們一般說的測序數(shù)據(jù)，比方說 6G 的測序數(shù)據(jù)，這個G代表的是 Gbase，而非文件大小 GB（gigabyte)Gbase 代表的是堿基數(shù)量，即測序文件（A,T,C...
