基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是：是指將一條序列分成包含k個(gè)堿基的子字符串，如果reads長度為L，k-mer長度設(shè)為k，則產(chǎn)生的...
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基因組組裝和注釋理論 -
就是你想call變異的區(qū)域
GATK Best Practices — step1 數(shù)據(jù)預(yù)處理（Data Pre-processing）
一、數(shù)據(jù)預(yù)處理（Data Pre-processing）介紹 這一步主要是對(duì)BWA得到的bam進(jìn)行一系列處理（包括sort/dup的標(biāo)記/堿基質(zhì)量值矯正），最終得到GATK ...
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如果搭建一個(gè)本地的conda鏡像（包含bioconda）
除非有特殊需求，比如說內(nèi)網(wǎng)服務(wù)器無法訪問外部網(wǎng)站，或者特別喜歡折騰，否則都沒有必要嘗試下面的操作 構(gòu)建一個(gè)conda本地鏡像，本質(zhì)上就是把a(bǔ)naconda的包都下載了，然后指...
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沒有什么不是認(rèn)真搞不定的?。?！