劉小澤寫于2020.5.29這篇文章做了一件事，就是幫助我們區(qū)分不同的批次矯正方法，然后比較了一下優(yōu)劣 文章題目：Flexible comparison of batch c...
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小澤看文獻 | 用BatchBench比較scRNA批次矯正方法 -
單細胞轉(zhuǎn)錄組WGCNA到底應(yīng)該怎么做？在做單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時候，獲得分群后我們希望知道每個群的marker基因是什么以此來描述細胞群的特征。其技術(shù)本質(zhì)就是利用某種規(guī)則獲得樣本（高変基因）或者每個亞群（差異基...
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Rstudio 運行作圖后不顯示圖片怎么破
plot(1:5,1:5)理論上，左邊輸命令，右邊出圖片，完美。實際上，plot，plot，plot，右邊無動于衷。哦好吧。生活就是這么奇葩。運行一下這兩行應(yīng)該會可以。我的解...
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R數(shù)據(jù)可視化5:熱圖Heatmap最近休息了幾天。沒有來得及更新。今天我們來講一講熱圖怎么繪制 什么是熱圖(Heatmap) 熱圖是一個以顏色變化來顯示數(shù)據(jù)的矩陣。Toussaint Loua在1873年就曾...
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【R>>RColorBrewer】神仙函數(shù)colorRampPalette首先聲明下面整理的內(nèi)容都來自于網(wǎng)絡(luò)，并在文末注明了引用的出處，本內(nèi)容僅用于學(xué)習(xí)交流，禁止用于商業(yè)用途，如有侵權(quán)，請聯(lián)系刪除。目前自己常用的調(diào)色R包有： ggsci[http:...
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CIBERSORT 免疫浸潤(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸潤計算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介紹CIBERSORT。 1.輸入數(shù)據(jù)要什么 下面這段話摘自CIBERSORT的介紹 Importantly...
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當小白遇到：參考基因組和基因組注釋1、啥是參考基因組和參考基因注釋？ 俗話說“大道至簡”，咱生物界表示：這我熟呀！君不見，我只用ATCG 四個堿基就能上天入地，外加海底兩萬里。嗯，沒毛?。?！自從 1990 啟...
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WGCNA（2a）：一步法完成網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和模塊檢測在上一篇帖子上完成了表達量數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)的整理，這篇文章將進行網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和模塊檢測。 WGCNA（1）：R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡書 (jianshu.com)[https...
