使用軟件:Geneious目的:對組裝好的葉綠體基因組進行注釋,注釋好后進行查看,無誤后繪制圈圖 【注釋部分】 1.首先從NCBI上下載一段與要注釋的物種(目標(biāo)序列)同源的物...
使用軟件:Geneious目的:對組裝好的葉綠體基因組進行注釋,注釋好后進行查看,無誤后繪制圈圖 【注釋部分】 1.首先從NCBI上下載一段與要注釋的物種(目標(biāo)序列)同源的物...
組裝并注釋完葉綠體基因組后,就要進行圈圖的繪制。這里使用在線網(wǎng)站OGDRAW來繪制圈圖。 主要參考教程:葉綠體基因組注釋、圈圖繪制~ CPGAVAS2,OGDRAW(圖文教程...
從基因組中提取啟動子序列,UTR序列往往是費時費力的過程。SPDE的gene模塊是專門為那些從事純粹實驗工作的老師與學(xué)生設(shè)計。其具體過程如下: 點擊SPDE的gene模塊(如...
寫在前面 半個月前,我推了一個《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程(原本事實是開給課題組)。在熱身課程(完全免費)中,將我個人對基因家族分析的認知和其意義均做了說明,感...
MECAT2是三代測序數(shù)據(jù)PacBio的高效組裝工具,是之前MECAT的改進版, 修復(fù)了之前的很多bug, 使用基于string graph的fsa替換了之前的mecat2c...
Counts值 對給定的基因組參考區(qū)域,計算比對上的read數(shù),又稱為raw count(RC)。計數(shù)結(jié)果的差異的影響因素:落在參考區(qū)域上下限的read是否需要被統(tǒng)計,按照什...
莎莎寫于2020.5.1學(xué)校第一批返校的同學(xué)已經(jīng)解封了,我還在賓館隔離我今天在這里立個Flag:每天都要寫簡書?哈哈哈,可能不太現(xiàn)實,但是至少今天是新的一個月的開始要好好學(xué)習(xí)...
寫在前面 2021年,新年第一天,我在忙著家里事情的間隙,分成五次(每次大概30min),錄制了 TBtools 的熱圖(Heatmap)功能的介紹與參數(shù)詳解。 TBtool...