運(yùn)行GATK時(shí),報(bào)錯(cuò):java.lang.IllegalArgumentException: samples cannot be empty這個(gè)問題在GATK Forum有...
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BUSCO是一款使用python語言編寫的對(duì)轉(zhuǎn)錄組和基因組組裝質(zhì)量進(jìn)行評(píng)估的軟件。在相近的物種之間總有一些保守的序列,而BUSCO就是使用這些保守序列與組裝的結(jié)果進(jìn)行比對(duì),鑒...
疫情突然襲來,好多實(shí)體店都關(guān)門了,原準(zhǔn)備也盤個(gè)店做點(diǎn)啥生意賺點(diǎn)錢呢,三年的疫情,現(xiàn)在沒有膽量去盤店了,深怕自己攜帶全家陷入泥潭無法自拔,還是保守點(diǎn)好了。 那么話說回來了,保守...
生信軟件、流程依賴的東西太多,docker打包鏡像一不小心就是上Gb大小。 鏡像太大很多缺點(diǎn):上傳、拉取慢;費(fèi)寬帶;占空間。。。 docker已廣泛應(yīng)用在IT,生信只是沾了點(diǎn)...
預(yù)測微生物對(duì)擾動(dòng)的反應(yīng)是微生物學(xué)的一個(gè)基本挑戰(zhàn)。大多數(shù)關(guān)于微生物組動(dòng)力學(xué)的研究都集中于研究微擾使動(dòng)物微生物群從健康狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榉墙】捣€(wěn)定狀態(tài)的模式。 本文提出了另一種設(shè)想,即許...
基因組組裝的三個(gè)層次,contig, scaffold和chromosomes.contig表示從大規(guī)模測序得到的短讀(reads)中找到的一致性序列。組裝的第一步就是從短片...