Cutadapt安裝 基本命令 例子： 常用參數(shù) 參數(shù)詳解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters：adapter...
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cutadapt 使用詳解 -
MaxQuant-linux版本使用弄完我才知道為何很多人吐槽這個(gè)軟件的Linux版本很難用，各種報(bào)錯(cuò)都是淚呀。大概正確的安裝和運(yùn)行操作如下，很多教程遇到的坑我就不寫了。 首先去maxquant的官網(wǎng)去獲得ma...
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MUMMER 兩個(gè)基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長度，所以一般都是逐個(gè)基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
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序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果可讀化處理（四）
關(guān)于該軟件的計(jì)算可選參數(shù)以及結(jié)果文件的解讀，見前三篇分享： 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[http://www.itdecent.cn/writer#/not...
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infernal預(yù)測ncRNA
一：下載安裝 二：下載數(shù)據(jù)庫 三： 確定待查詢的核苷酸序列或基因組的大小，作為后續(xù)命令的參數(shù) 其輸出結(jié)果中有一行，Total # of residues: 218502668...
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序列比對軟件 MUMmer 高級使用（二）
快速上手的話見上一篇，這篇詳細(xì)介紹一下 MUMmer 4 軟件下 nucmer 程序的詳細(xì)參數(shù)。 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.jian...
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應(yīng)該是最新最詳細(xì)的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長度，所以一般都是逐個(gè)基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方...
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我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
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計(jì)算分子進(jìn)化-搞懂PAML的正選擇分析許多基因組的文章里都會(huì)提到使用PAML進(jìn)行基因的正選擇分析(positive selection), 網(wǎng)上也有一些教程介紹如何用PAML進(jìn)行分析。無論是文章，還是教程，大多只...
