前一篇推送解讀了2022年發(fā)表在DC上的關(guān)于擬南芥再生的文章。文章種利用TOBIAS鑒定了轉(zhuǎn)錄因子的活性。本次推送將介紹這款軟件的原理及使用。 TOBIAS——2020NC ...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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生信分析7：如何利用ATAC-seq數(shù)據(jù)鑒定轉(zhuǎn)錄因子活性 -
sctransform通過仿射變化對(duì)單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化參考文獻(xiàn)鏈接：《Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regu...
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利用AUC來評(píng)估scRNA相同細(xì)胞類型在兩個(gè)處理組別的差異前言 讀《Cell type prioritization in single-cell data》[https://www.nature.com/articles/s415...
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評(píng)估單細(xì)胞數(shù)據(jù)融合效果
前言 本文，作者利用局部逆辛普森系數(shù)評(píng)估harmony整合兩套單細(xì)胞數(shù)據(jù)的效果，作者利用局部逆辛普森系數(shù)評(píng)估了harmony整合不同批次單細(xì)胞數(shù)據(jù)的效果 摘自《Fast, s...
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人是環(huán)境的產(chǎn)物每天學(xué)點(diǎn)時(shí)間管理！ R:用90天來改變自己，加入一些圈子. C:上半年組織了幾場(chǎng)打卡學(xué)習(xí)的活動(dòng)，一開始沒有想到會(huì)有些什么太大的收獲，但是一個(gè)月又一個(gè)月的堅(jiān)持下來之后發(fā)現(xiàn)，群里...
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基因表達(dá)趨勢(shì)分析-2：Mfuzz基因表達(dá)趨勢(shì)分析-1：TCseq[http://www.itdecent.cn/p/b808085c7351] Mfuzz能夠識(shí)別表達(dá)譜的潛在時(shí)間序列模式，并將相似模式的基...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資源
(1). 單細(xì)胞上游軟件cellranger：?jiǎn)渭?xì)胞上游軟件cellranger從頭說[http://www.itdecent.cn/p/9a09f7ad9d93] (2)...
