論文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-axis sediments https://www.natur...
IP屬地：廣東
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跟著Nature Communication學(xué)作圖：R語言ggplot2話點(diǎn)線圖展示基因表達(dá)量的范圍 -
跟著Nature學(xué)作圖：R語言pheatmap包做熱圖論文是 Environmental factors shaping the gut microbiome in a Dutch population 數(shù)據(jù)和代碼的github...
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DEseq2差異表達(dá)分析
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繞不過差異分析。為什么選擇這兩個包呢？DEseq2針對有生物學(xué)重復(fù)的樣本。（一般情況下應(yīng)該是都需要生物學(xué)重復(fù)的）edgeR對于單個樣本是比較好的。（但是細(xì)胞材料真的...
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空間轉(zhuǎn)錄組結(jié)合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析（hot）追熱點(diǎn)，好嗎？當(dāng)然好，只要有足夠的基金，熱點(diǎn)還是比較容易發(fā)大文章的，但是需要注意，測序前還是應(yīng)該有合理，目的明確的課題設(shè)計！（目前空間轉(zhuǎn)錄組測序就一個字貴!貴!貴!） Nat...
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TCGA芯片數(shù)據(jù)下載及差異分析
好久沒更新了，最近有點(diǎn)頹，但是該做的事情還是要繼續(xù)。外包實(shí)驗(yàn)的事情最近搞得頭大，要用一丟丟錢，做很多事情，這個真的是難，尤其是和公司談判，心累。 今天我來做一下TCGA芯片數(shù)...
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轉(zhuǎn)載：tcga壓縮包提取合并_《TCGA數(shù)據(jù)下載的終極篇》原文來自轉(zhuǎn)載 CSDN原文地址[https://blog.csdn.net/weixin_31741271/article/details/111948968?utm_med...
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RNA-seq的差異基因除了熱圖/火山圖，你還可以如何展示？差異基因展示方式除了熱圖、火山圖，還有傳說中的“瀑布圖”（不確定是不是叫瀑布圖，我感覺更像S型圖），近兩天我在瀏覽簡書的時候發(fā)現(xiàn)了一篇好文，來自簡書作者ZZZZZZ_XX[h...
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R的內(nèi)存控制與管理
你是否也遇到過這樣的報錯信息呢？這條報錯信息的意思是R不能再獲得2.5Gb的運(yùn)行內(nèi)存，也就是分配給R的內(nèi)存不足。R在運(yùn)行過程中將所有的數(shù)據(jù)都儲存在RAM中，因此在操作大的數(shù)據(jù)...
