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irGSEA：基于秩次的單細(xì)胞基因集富集分析整合框架（修訂版）一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法，如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScor...
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irGSEA：基于秩次的單細(xì)胞基因集富集分析整合框架（中文教程）一、背景 在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中，整合多樣本數(shù)據(jù)進行分析逐漸成為一種趨勢。越來越多的研究者趨于使用未校正批次效應(yīng)后的數(shù)據(jù)進行差異基因分析。他們認(rèn)為...
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數(shù)據(jù)清洗
一、數(shù)據(jù)的讀取與導(dǎo)出 ①. 讀取數(shù)據(jù):txt、csv和xlsx文件 · 速度最慢 · 中等速度 · 速度最快 ②. 數(shù)據(jù)導(dǎo)出：導(dǎo)出為txt、cs...
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R語言極簡入門一、R與Rstudio的安裝 · R可以在CRAN上免費下載：(https://www.r-project.org/[https://www.r...
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ggplot2極簡入門一、基本思想和語法框架 基本思想：圖形分層是關(guān)鍵，圖形疊加靠+來實現(xiàn) 基本語法框架如下： 其中，ggplot()+geom_xxx() | st...
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正則表達式（stringr包）
前言 R語言的stringr包是由大名鼎鼎的Hadley Wickham開發(fā)，是對于stringi的進一步封裝。這個人有多牛，因為他數(shù)據(jù)處理和可...