@D_K Matrix包升到 1.5-3版本試試
irGSEA：基于秩次的單細胞基因集富集分析整合框架（修訂版）一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法，如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...
IP屬地：河北
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Matrix包和Seurat包版本沒有匹配上。你的Matrix包和Seurat包的版本分別是多少？
irGSEA：基于秩次的單細胞基因集富集分析整合框架（修訂版）
一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法，如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...
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irGSEA：基于秩次的單細胞基因集富集分析整合框架（修訂版）一、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法，如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...
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這個錯誤的原因是因為AUCell包更新了，在運行AUCell_buildRankings函數(shù)時，需要將參數(shù)splitByBlocks設置為T。我更新了irGSEA包，解決了這個問題，你可以重新安裝irGSEA包解決這個問題（devtools::install_github("chuiqin/irGSEA")）。但如果你不想更新irGSEA包的話，可以將AUCell包的版本降到1.14.0，也可以解決這個問題。
irGSEA：基于秩次的單細胞基因集富集分析整合框架（中文教程）
一、背景 在單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中，整合多樣本數(shù)據(jù)進行分析逐漸成為一種趨勢。越來越多的研究者趨于使用未校正批次效應后的數(shù)據(jù)進行差異基因分析。他們認為，校正批次效應后的數(shù)據(jù)，會掩蓋...
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irGSEA：基于秩次的單細胞基因集富集分析整合框架（中文教程）一、背景 在單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中，整合多樣本數(shù)據(jù)進行分析逐漸成為一種趨勢。越來越多的研究者趨于使用未校正批次效應后的數(shù)據(jù)進行差異基因分析。他們認為，校正批次效應后的數(shù)據(jù)，會掩蓋...
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遺傳學 博士
