前言:微博參與話題 #給你四年時間你也學(xué)不會生信# 轉(zhuǎn)載自:R語言做圖plot參數(shù)更多參考:R語言中plot()函數(shù)里的6種邊框R中設(shè)置圖形參數(shù)--函數(shù)par()詳解 圖形參...
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WGCNA分析基于兩個假設(shè):1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路,2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布?;谶@兩點(diǎn),可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
劉小澤寫于2018.8.27-28我們?nèi)粘J褂肦一般不會使用它的編程工作(即寫R包的任務(wù)),許許多多的的生信函數(shù)、統(tǒng)計軟件也都是現(xiàn)成的,我們要做的最繁瑣、最耗時的工作就是對數(shù)...
劉小澤寫于19.7.8-第二單元第八講:乳腺癌領(lǐng)域之PAM50分類筆記目的:根據(jù)生信技能樹的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在:http:/...
clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個R包,可以用來做各種富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reacto...
差異分析流程示例與資料 基因芯片的差異表達(dá)分析主要有 構(gòu)建基因表達(dá)矩陣、構(gòu)建實(shí)驗(yàn)設(shè)計矩陣、構(gòu)建對比模型(對比矩陣)、線性模型擬合、貝葉斯檢驗(yàn)和生成結(jié)果報表 六個關(guān)鍵步驟。 下...