一、引言 在基因組學的世界里，四膜蟲（Tetrahymena thermophila）早已聲名遠揚。作為一種單細胞真核生物模型，它不僅在基礎生物學研究中扮演著關鍵角色，還因其...
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IP屬地：湖北
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協(xié)同的力量：DRS聯(lián)合RNA-seq和表觀遺傳組學“煥新”四膜蟲基因組 -
單細胞轉錄組測序：從短讀長到長讀長的跨越一、引言 細胞作為生命的基本單位，承載著遺傳信息并執(zhí)行著復雜多樣的生物學功能。然而，細胞之間存在著顯著的異質性，這種異質性不僅體現(xiàn)在細胞類型和狀態(tài)上，還體現(xiàn)在基因表達模式和分...
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小鼠視網(wǎng)膜轉錄組異構體全解析：單細胞三代全長測序技術放異彩研究背景 視網(wǎng)膜作為視覺信息處理的關鍵部位，其復雜性遠超我們的想象。小鼠視網(wǎng)膜是一個高度復雜的神經(jīng)組織，包含超過130種獨特的神經(jīng)細胞類型，這些細胞被分為7個主要類別，而每個...
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破譯生命密碼的終極利器：DRS在復雜轉錄組研究中的應用一、引言：復雜轉錄組，揭示生命調控的關鍵維度 在后基因組時代，科學研究的焦點早已從“基因有哪些”轉向“基因如何被調控”。RNA分子的多樣性，正是揭示這一過程的核心線索。而所謂...
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融合基因檢測的最終解決方案——Nanopore Direct RNA Sequencing解鎖融合基因檢測新范式一、引言 在精準醫(yī)療的加速推動下，融合基因正成為連接基礎研究與臨床應用的橋梁。作為多種惡性腫瘤的關鍵驅動因素，融合基因不僅揭示著細胞命運被改寫的分子起點，也深刻影響著疾病的診...
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RNA修飾直測技術革命 ——納米孔直接RNA測序如何重塑RNA表觀遺傳學研究一、引言：RNA修飾研究的痛點與納米孔測序的革命 在生命科學的浩瀚圖景中，RNA分子不僅僅是遺傳信息傳遞的中間載體，更是細胞內精密的調控者。它們通過多種多樣的化學修飾，在不改...
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Nanopore Direct RNA Sequencing技術白皮書一、引言｜RNA世界的新紀元 RNA，作為連接遺傳信息與功能執(zhí)行的關鍵分子，早已不再只是DNA到蛋白質的“信使”。近年來，大量研究表明，RNA分子的轉錄起始、剪接變異、pol...
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DRS應用十佳案例：解鎖nanopore全長RNA直接測序的變革性力量RNA分子是生命活動的核心調控者，其復雜性遠超我們的想象。從多樣化的異構體到豐富的化學修飾，再到動態(tài)的表達變化，RNA的這些特性使其在細胞功能和疾病發(fā)生中扮演著關鍵角色。然而...
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單細胞長讀長靶向測序技術揭示卵巢癌轉錄組變異一、研究背景 單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術在解析細胞類型、狀態(tài)和動態(tài)變化方面發(fā)揮著重要作用，但傳統(tǒng)的短讀長測序技術在全面表征RNA異構體方面存在不足。為克服限制...
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從London Calling看Nanopore在RNA相關技術的新進展2025年 5 月 20 日至 23 日，牛津納米孔科技公司（Oxford Nanopore Technologies，以下簡稱 ONT）舉辦了備受矚目的 London Ca...
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RNA編輯影響腫瘤耐藥機制——ADAR1高表達腫瘤相關巨噬細胞誘導結直腸癌耐藥性一、研究背景 結直腸癌（Colorectal Cancer, CRC）是全球第三大常見癌癥類型，其治療一直是醫(yī)學領域的重大挑戰(zhàn)。在 CRC 的治療中，腫瘤相關巨噬細胞（Tum...
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對基因集進行差異分析？除了用MSigDB搞GSEA，文獻中還這樣做......引言 GO/KEGG富集分析前，常會對基因進行差異分析，獲得DEG。然而，你可曾聽過這樣一種分析，可以直接對基因集進行差異分析？ 說到基因集，可能大家最先想到的是GSEA。前...
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文章被argue，竟是由于ChIP后的WB？ChIP后的WB多重要？ 近些年來，越來越多的期刊雜志對WB結果進行嚴格要求。比如：“提供未經(jīng)編輯的WB原始圖像”、“進行條帶間比較分析時，應在同一張膜上”、“不接受高對比度...
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2024-07-24差異基因偏少，你可能漏了這個…… 引言 主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）是一種數(shù)據(jù)降維和特征提取的分析方法，通過正交變換將一組可...
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2024-07-23m6A是真核生物mRNA最普遍和最豐富的一種轉錄后修飾，目前發(fā)現(xiàn)m6A修飾在發(fā)育、增殖、分化、癌癥發(fā)生等很多生物學過程中起著重要的調控作用。meRIP-seq是目前m6A研究...
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2024-05-14差異基因中找不到關注的基因，如何解決？ 組學研究中，有時我們會遇到這樣的情況：GO/KEGG富集分析中出現(xiàn)了我們比較感興趣的通路，但是卻找不到預期關注的基因。進一步檢查發(fā)現(xiàn)關...
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