在RNAseq數(shù)據(jù)處理的過程中,有的時(shí)候需要寫循環(huán)或者提交任務(wù)到服務(wù)器。這個(gè)時(shí)候vim編輯器就很好用了。 image.png 使用方式:vi + < 文件名>(后綴可以是.s...
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在RNAseq數(shù)據(jù)處理的過程中,有的時(shí)候需要寫循環(huán)或者提交任務(wù)到服務(wù)器。這個(gè)時(shí)候vim編輯器就很好用了。 image.png 使用方式:vi + < 文件名>(后綴可以是.s...
Trimmomatic 是基于java的多功能的工具,用于預(yù)處理讀段。Trimmomatic 可以刪除接頭,而且以基于質(zhì)量的不同的方式對(duì)讀段進(jìn)行修剪。它也可以基于質(zhì)量和長(zhǎng)度對(duì)...
在用conda安裝包時(shí),有時(shí)會(huì)報(bào)錯(cuò)。 例如此處的tophat包的安裝: 仔細(xì)看報(bào)錯(cuò)信息,這里的原因是python版本發(fā)生了沖突。對(duì)于我這個(gè)包來說需要python2.7,但我這...
運(yùn)行multiqc時(shí)出錯(cuò),錯(cuò)誤為:RuntimeError: Click will abort further execution because Python 3 was ...
在閱讀文獻(xiàn)時(shí),會(huì)得到一些轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)。那么我們?nèi)绾蜗螺d這些轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)呢?以SRR1039510為例 一般轉(zhuǎn)錄組分析都會(huì)在服務(wù)器上進(jìn)行,所以在下載之前,需要配置好環(huán)境,下載好相...