表達(dá)譜分析中，經(jīng)常會(huì)使用到相關(guān)性分析，探索一組基因間的共表達(dá)特征。例如，這些基因間的表達(dá)是否存在較強(qiáng)的協(xié)同性，一個(gè)基因表達(dá)值的改變是否與另一個(gè)基因表達(dá)值改變顯著相關(guān)，它們之間...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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基因表達(dá)相關(guān)性也可以用弦圖可視化（R語(yǔ)言） -
m6A甲基化對(duì)我來(lái)說(shuō)就是好新鮮
前言 俗話說(shuō)“文獻(xiàn)是最好的老師”，但是隔行如隔山，在科研界，隔著一個(gè)領(lǐng)域就有一個(gè)巨大的鴻溝。就比如就算做腫瘤研究的人，看免疫學(xué)領(lǐng)域的文章還是會(huì)頭皮發(fā)麻，看到總是記不住的CD4...
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生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)的使用superqun 原創(chuàng)于簡(jiǎn)書 手工目錄： Q1:如何在肺癌數(shù)據(jù)庫(kù)中選出k-ras突變的病人樣本。 1. 使用GDC下載。 在GDC portal頁(yè)面中選擇Exploratio...
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【r<-繪圖|ROC】ROC的計(jì)算與繪制最近工作需要繪制ROC曲線，對(duì)該曲線的計(jì)算細(xì)節(jié)進(jìn)行了一番摸索。當(dāng)前搜索ROC曲線一般跟機(jī)器學(xué)習(xí)相關(guān)聯(lián)，導(dǎo)致我對(duì)它的概念有了曲解，理所當(dāng)然地以為它只是一個(gè)用于機(jī)器學(xué)習(xí)的分類器評(píng)...
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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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【r<-數(shù)據(jù)分析】使用R進(jìn)行探索性分析EDA該部分學(xué)習(xí)內(nèi)容來(lái)自《R for Data Science》。 這次我們學(xué)習(xí)可視化與處理數(shù)據(jù)來(lái)系統(tǒng)地探索數(shù)據(jù)——統(tǒng)計(jì)學(xué)家稱之為探索性數(shù)據(jù)分析（exploratory data ...
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聽(tīng)說(shuō)你也有 emojifont 的字體使用困惑說(shuō)明：因?yàn)槠脚_(tái)限制和平臺(tái)廣告等原因，今后的文章將不在簡(jiǎn)書更新，請(qǐng)移步并訂閱個(gè)人博客說(shuō)明：因?yàn)槠脚_(tái)限制和平臺(tái)廣告等原因，今后的文章將不在簡(jiǎn)書更新，請(qǐng)移步并訂閱個(gè)人博客說(shuō)明：因?yàn)?..
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互相影響
不知道有沒(méi)有什么事情是因?yàn)槟愕拇嬖诙屇阒車娜税l(fā)生了變化？又有沒(méi)有什么事情是因?yàn)樯磉叺娜硕羁痰母淖兞四悖?據(jù)我的觀察，我身邊越來(lái)越多的人因?yàn)槲宜坪醭霈F(xiàn)了下面幾種情況。 越...
