Rprofile 文件位于R安裝目錄下的library/base/R/Rprofile，沒錯(cuò)，是在base包下面。 相當(dāng)于配置文件的功能，打開之后可以看到預(yù)設(shè)了很多東西，比如...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
-
Rprofile -- 自定義你的R啟動(dòng)方式
-
-
交互運(yùn)行R時(shí)如何不顯示啟動(dòng)信息？
每次運(yùn)行R時(shí)都會(huì)輸出很多提示信息，除了版本信息幾乎沒有用，那么我們可以不顯示這些消息。 只需要加上參數(shù)-q即可 另外，每次退出時(shí)都會(huì)詢問是否保存當(dāng)你工作空空間，可以使用--n...
-
DNA甲基化數(shù)據(jù)分析全流程
2021-01-01 更新 簡(jiǎn)單記錄一下平時(shí)的分析過程 和RNA-seq前期流程類似 -- 質(zhì)控、去接頭、比對(duì)參考基因組、排序 后期就是要提取甲基化位點(diǎn)，包括CpG、CHG、...
-
MAnorm2：ChIP-seq數(shù)據(jù)分組比較軟件
前言 ??ChIP-seq 技術(shù)是研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的重要手段，被廣泛用于揭示轉(zhuǎn)錄因子和組蛋白修飾在全基因組范圍內(nèi)的結(jié)合位點(diǎn)的分布情況。近年來，隨著實(shí)驗(yàn)技術(shù)的發(fā)展和測(cè)...
-
R實(shí)戰(zhàn) | 文章第一表:三線表的繪制[TOC] 簡(jiǎn)介 大多數(shù)期刊文章的第一個(gè)表，即Table 1，是根據(jù)暴露程度分層的研究人群基線特征的描述性統(tǒng)計(jì)表。table1 包使得使用R生成這樣一個(gè)表非常簡(jiǎn)單。結(jié)果輸出格...
-
R包 clusterProfiler: GO和KEGG富集結(jié)果顯示基因symbol
1.加載包 2. GO分析 注：1）MF和CC方法同BP,將BP改為MF,CC即可。2）可視化中，showCategory為顯示的item數(shù)，scale_y_discrete...
-
R語言 -- ggplot 畫圖小技巧
并沒有什么小技巧，只是我的腦殼總是記不住的東西 簡(jiǎn)單組圖 barplot 分頁 提示信息設(shè)為英語 更新所有R包 指定R包安裝路徑 快速獲取R版本 任意位置添加文本注釋 添加虛...
