dada2插件對原始數(shù)據(jù)paired-end-demux.qza進(jìn)行質(zhì)量過濾需要兩個(gè)參數(shù)，trunc-len-f和trunc-len-r。這個(gè)想法是通過盡可能多地刪除較低質(zhì)量...
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微生物多樣性qiime2分析流程(3) 使用figaro來得到dada2正反向截?cái)鄥?shù)
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一起學(xué)算法-35. 搜索插入位置
一、題目 LeetCode-35. 搜索插入位置鏈接：https://leetcode-cn.com/problems/search-insert-position/[htt...
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R語言實(shí)現(xiàn)Alpha多樣性指數(shù)的計(jì)算
R語言實(shí)現(xiàn)Alpha多樣性指數(shù)的計(jì)算 上次我們已經(jīng)使用R語言來對OTU表的抽平分析，那么我們?nèi)绾问褂贸槠胶蟮腛TU表來重新計(jì)算Alpha多樣性呢？接下來我們就來學(xué)習(xí)一下。 不...
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馬鈴薯也能用種子種了？你見過馬鈴薯種子嗎？在大家的普遍認(rèn)知里種馬鈴薯都是用馬鈴薯塊去種的。 塊莖繁殖存在的問題 馬鈴薯是茄科植物，也會開花結(jié)果。但是在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中，并不用種子來種植，而是用馬鈴薯的塊...
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學(xué)術(shù)網(wǎng)址導(dǎo)航網(wǎng)站上線了題外話，前兩天就該上線的，一直拖啊拖...... 關(guān)于網(wǎng)站 之前我給大家推薦了一些開源的網(wǎng)址導(dǎo)航網(wǎng)站，所以我也打算自己寫一個(gè)學(xué)術(shù)類網(wǎng)址導(dǎo)航不多，就算有大多還有一股上世紀(jì)的風(fēng)格...
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R語言實(shí)現(xiàn)OTU表的抽平分析
R語言實(shí)現(xiàn)OTU表的抽平分析 好久沒有更新文章了，抱歉，今天我們先來講一下抽平。相信大家平常在16s RNA 測序后，一般都會對測序數(shù)據(jù)劃分后生成的OTU表進(jìn)行抽平，保證保證...
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