需要在服務(wù)器運(yùn)行R,clusterprofile裝不上報錯“Package libcurl was not found in the pkg-config search pa...
需要在服務(wù)器運(yùn)行R,clusterprofile裝不上報錯“Package libcurl was not found in the pkg-config search pa...
一直有這個報錯如下: /opt/R/4.1.3/lib/R/include/ft2build.h:37:38: fatal error: freetype/config/ft...
研三即將畢業(yè),感覺自己什么都不會,但是什么都感覺自己學(xué)了一點。迷茫無力。 摸魚看了靈能百分百 “既然你在為過去后悔,就該慶幸自己醒悟得及時啊?!? ...
本人使用的R中很多包突然更新要4.1.3版本,更新后重新出現(xiàn)了這個問題。之前有出現(xiàn)過這個問題被我解決了,但是當(dāng)時沒有筆記不得不重新進(jìn)行尋找解決的方案,隱約記得數(shù)據(jù)是對包和基礎(chǔ)...
vscode:Bad owner or permissions on .ssh/config 解決方案,備份.ssh下的文件,使用powershell管理員模式,cd 到路徑...
但是博主有沒有遇到過很多做完ballgown后還是mstrg的沒有注釋上的基因呢?這種是需要使用blast2go來解決么?
轉(zhuǎn)錄組全記錄:從rawdata到DEG功能富集寫在前面:本文是新手學(xué)習(xí)全記錄,僅供參考,歡迎交流! 1. rawdata 1.1 QC 1.2 數(shù)據(jù)量統(tǒng)計 調(diào)用工具:iTools使用: 2. cleandata 2.1 ...
寶藏,做完了ballgown之后不知道如何下一步,不知道博主是什么思路。這篇給了我很多啟發(fā)
轉(zhuǎn)錄組全記錄:從rawdata到DEG功能富集寫在前面:本文是新手學(xué)習(xí)全記錄,僅供參考,歡迎交流! 1. rawdata 1.1 QC 1.2 數(shù)據(jù)量統(tǒng)計 調(diào)用工具:iTools使用: 2. cleandata 2.1 ...
終于看到使用ballgown的教程了,小白狂喜。
但是作者我發(fā)現(xiàn)很少有人用這個ballgown發(fā)文章,流程都發(fā)布了5年了(雖然我的檢索詞匯可能有問題),但多數(shù)還是使用的DEseq2,是因為這個流程中存在一些問題么?
那個gene name 轉(zhuǎn)換為ensemble ID 真的是和其他人的做法反過來。
使用R語言的clusterProfiler對葡萄做GO富集分析葡萄的參考基因組下載自NCBI,下載鏈接是https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/003/745/GCF_00000...