Ubuntu安裝Pythorch需要先屏蔽掉系統(tǒng)自帶的顯卡驅(qū)動(dòng)器，安裝合適的NVIDIA顯卡驅(qū)動(dòng)，方法參考顯卡安裝篇；ubuntu電腦需要安裝anaconda，新建TORCH...
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Ubuntu安裝Pytorch方法
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conda或pip安裝軟件下載速度慢又超時(shí)的解決辦法
Pip 安裝我在使用pip安裝軟件時(shí)常遇到網(wǎng)速極慢，鏈接超時(shí)自動(dòng)斷開(kāi)。解決方法參考別人帖子：1）更換為國(guó)內(nèi)鏡像源；2）更改鏈接時(shí)間限制；以下載pytorch為例：原始命令： ...
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Ubuntu18.04安裝NVIDIA驅(qū)動(dòng)方法
NIVDIA驅(qū)動(dòng)安裝需要先查看自己電腦里驅(qū)動(dòng)芯片型號(hào)： 顯示我的電腦安裝有‘NVIDIA Corporation GK208B [GeForce GT 710] (rev a...
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利用selenium爬取pubmed，獲得搜索的關(guān)鍵字最近五年發(fā)表文章數(shù)量PubMed 是一個(gè)提供生物醫(yī)學(xué)方面的論文搜尋以及摘要，并且免費(fèi)搜尋的數(shù)據(jù)庫(kù)。是一個(gè)做生物方面經(jīng)常要用到的一個(gè)查找文獻(xiàn)的網(wǎng)站。最近剛學(xué)了爬蟲(chóng)相關(guān)的知識(shí)包括urllib庫(kù)，re...
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Ubuntu18.04安裝配置問(wèn)題解決方法1. 更改 sources.list 與自動(dòng)更新 使用aliyun鏡像來(lái)源： 將其更改替換全部的/etc/apt/sources.list (sudo vim 命令打開(kāi))，之...
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maftools使用maftools是對(duì)WGS和WES數(shù)據(jù)進(jìn)行上游分析之后，進(jìn)行somatic mutation分析的一個(gè)非常好用的包，用非常簡(jiǎn)短的幾行代碼即可出圖。 1.安裝 maftools...
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RNA-seq分析：從fastq到差異表達(dá)基因
RNA-seq的數(shù)據(jù)分析是比較簡(jiǎn)單基礎(chǔ)的分析，大概流程就是處理下機(jī)的fastq數(shù)據(jù)（trimmomatic），比對(duì)到人類基因組（hisat2）然后統(tǒng)計(jì)每個(gè)基因上出現(xiàn)的coun...
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單細(xì)胞測(cè)序R包PAGODA使用pagoda是2016年在nature methods發(fā)表的一個(gè)分析單細(xì)胞測(cè)序的方法，這個(gè)包并不是很紅火，只是最近在學(xué)習(xí)另一個(gè)基于RNA速率推斷細(xì)胞演化的R包velocyto...
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R packages搜索神器pkgsearch使用
R學(xué)習(xí)使用中，我們經(jīng)常需要使用各種分析神器——package包。各種包的使用，不僅加快了數(shù)據(jù)分析的速度，也將某些不可能變成可能。那么，在海量第三方應(yīng)用中，如何找到我們最需要、...
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機(jī)器學(xué)習(xí)入門(mén)知識(shí)整理
1. 機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)知識(shí)入門(mén) 入門(mén)知識(shí)我沒(méi)有太多可講的，詳細(xì)原理與基礎(chǔ)知識(shí)可參考https://www.cnblogs.com/subconscious/p/4107357.h...
