發(fā)簡信
IP屬地：上海
-
snpEff使用說明（下）-SnpEff注釋SNP/INDEL上一期，給大家介紹了SnpEff注釋數(shù)據(jù)庫。這一期著重介紹SnpEff的命令，最后一期介紹注釋結(jié)果解析 準備文件已經(jīng)注釋好的物種SnpEff注釋...
-
snpEff使用說明（上）-了解及創(chuàng)建SnpEff注釋數(shù)據(jù)庫SnpEff是一款注釋變異位點（SNP+InDel+MNP）和預(yù)測變異對基因的影響（例如氨基酸變化）的工具。 用法： 輸入文件：輸入是變異位點（...
-
R繪制火山圖 EnhancedVolcano+ggplot什么是火山圖？ 火山圖其實是一種很形象的叫法，它可以通過關(guān)注對象的落點從而直觀地展示該對象的所屬區(qū)域。其通常用于展示差異結(jié)果，比如RNA-seq...
-
pheatmap 相關(guān)性熱圖 基因表達量熱圖熱圖 熱圖概念：熱圖是一個以顏色變化來顯示數(shù)據(jù)的矩陣，可以簡單地聚合大量數(shù)據(jù)，并使用一種漸進的色帶直觀地展現(xiàn)空間數(shù)據(jù)的相對大小。 熱圖在生物學(xué)中...
-
clusterProfiler基因功能富集分析 +氣泡圖1. 非模式生物 非模式生物需要提前從AnnotationHub抓取目標(biāo)物種的OrgDb數(shù)據(jù)庫，這個庫里包括Uniport，ENSEMBL，EN...