@Vanvan沒想到 對(duì)的，還沒有畢業(yè)～最后一年啦
我想做個(gè)理想主義者昨天（6.17）是一年一度的生日。一如既往，要進(jìn)行一番自我思考、自我剖析。 緣分妙不可言 本科畢業(yè)4年，碩士畢業(yè)1年，9月即將正式入學(xué)讀生物博士。8年前，高考結(jié)束的那一刻，我...
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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對(duì)的，在蔣老師實(shí)驗(yàn)室。還沒有，快啦
我想做個(gè)理想主義者
昨天（6.17）是一年一度的生日。一如既往，要進(jìn)行一番自我思考、自我剖析。 緣分妙不可言 本科畢業(yè)4年，碩士畢業(yè)1年，9月即將正式入學(xué)讀生物博士。8年前，高考結(jié)束的那一刻，我...
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@sunny_ab1b 可以搜一下網(wǎng)上的資料，有很多關(guān)于DEseq2的教程～
RNA-seq:Kallisto+Sleuth (2)
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth，所以我們本次介紹如何使用Sleuth進(jìn)行相關(guān)的分析。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后，我們經(jīng)常做的分析之一就是差異...
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@sunny_ab1b 差異基因數(shù)量和樣本可能也有很大的關(guān)系
RNA-seq:Kallisto+Sleuth (2)
Kallisto下游推薦的分析軟件是Sleuth，所以我們本次介紹如何使用Sleuth進(jìn)行相關(guān)的分析。 RNA-seq在完成轉(zhuǎn)錄本的鑒定及定量后，我們經(jīng)常做的分析之一就是差異...
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@hjl7513 人生就是反復(fù)陷入思考與迷茫
比任何時(shí)候都要接近夢想
如果說每個(gè)人的人生必然會(huì)遇到幾個(gè)轉(zhuǎn)折點(diǎn)，那我絕對(duì)相信2020年會(huì)成為我人生的一個(gè)轉(zhuǎn)折點(diǎn)，甚至是一個(gè)重大轉(zhuǎn)折點(diǎn)。 這么想來，或許2019年所做的大部分事情都是為2020年作鋪墊...
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@一條生物狗 過了很多年的回復(fù)??
Qiime1-1.介紹
倒騰學(xué)習(xí)了一段時(shí)間的qiime1和qiime2，決定苦心整理一下學(xué)習(xí)成果。雖然不知道啥時(shí)候才能更完。主要參考下述網(wǎng)站的分析流程：https://twbattaglia.git...
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六種方法查看R函數(shù)源代碼，為啥第三種最惹人喜歡？所謂：操千曲而后曉聲，觀千劍而后識(shí)器。 作為一個(gè)開源軟件，R的一個(gè)非常大的優(yōu)點(diǎn)就是我們可以隨意查看所有算法的源代碼，在對(duì)這些源代碼進(jìn)行分析的過程中不僅可以加深對(duì)算法的認(rèn)識(shí)，而...
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@我們一起舔過鐵欄桿 感謝幫忙回復(fù)。
R數(shù)據(jù)可視化20:弦圖
終于超過1k粉絲啦～之前說要小小慶祝一下，害怕直接放文章里會(huì)被封文章，所以福利大家可以見評(píng)論。前幾周忙著答辯畢業(yè)事宜沒有時(shí)間更新，雖然這幾天也挺忙哈哈哈哈，不過還是要定期更新...
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@z_969d 最近看到作者在github上回復(fù)了這個(gè)問題，說是雖然novoeq 6000前面的模型結(jié)果會(huì)有點(diǎn)奇怪，但是不影響后續(xù)的使用，詳見：https://github.com/benjjneb/dada2/issues/1524
ASV和OTU有什么不同？哪個(gè)更好？
遇到了一個(gè)16S的課題，于是開始認(rèn)真學(xué)習(xí)ASV和OTU的差別，順手整理一下。 擴(kuò)增子測序和鳥槍法測序已經(jīng)成為微生物組領(lǐng)域最常見的研究手段。盡管鳥槍法測序可以為我們提供更高分辨...
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@z_969d 因?yàn)檫@款測序儀對(duì)測序質(zhì)量的評(píng)分變化了 只有幾個(gè)等級(jí) 因此在建立error模型的時(shí)候會(huì)出現(xiàn)問題??
ASV和OTU有什么不同？哪個(gè)更好？
遇到了一個(gè)16S的課題，于是開始認(rèn)真學(xué)習(xí)ASV和OTU的差別，順手整理一下。 擴(kuò)增子測序和鳥槍法測序已經(jīng)成為微生物組領(lǐng)域最常見的研究手段。盡管鳥槍法測序可以為我們提供更高分辨...
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@cbf7ac7e39f2 那我也沒了??
GenVisR包：突變類型不在waterfall函數(shù)指定范圍？
GenVisR包是一個(gè)用于基因組可視化的包。為我們提供了多種用于展示基因組突變、基因突變等圖像，包括我們熟知的基因突變瀑布圖等。今天介紹該包中的waterfall函數(shù)功能。 ...
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@壹生醫(yī)路 給的變量不是數(shù)值
R數(shù)據(jù)可視化1: 火山圖
拖延癥讓我一直疲于整理qiime2的分析過程。而且手上暫時(shí)也沒有相應(yīng)的16S數(shù)據(jù)要分析，所以打算整理整理R的畫圖腳本。而且總是百度一些畫圖細(xì)節(jié)讓我“厭倦”了，覺得自己急需整理...
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周運(yùn)來，男，長大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||冗余分析（RDA）概述冗余分析（redundancy analysis，RDA）是一種回歸分析結(jié)合主成分分析的排序方法，也是多響應(yīng)變量（multiresponse）回歸分析的拓展。從概念上講，RD...
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@花瓣雨落下花開半夏 不好意思，沒有做過這兩類RNA的注釋，不太清楚流程
R實(shí)例：limma包分析Agilent 4x44K Arrays
目前網(wǎng)頁上常見的是使用Affy的包對(duì)Affymetrix的芯片分析教程，而忽略了對(duì)其他平臺(tái)芯片分析。limma包是一個(gè)針對(duì)芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的R包，支持不同平臺(tái)的芯片數(shù)據(jù)。 數(shù)...
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from 和 to是一條連線兩頭的兩個(gè)節(jié)點(diǎn)，value是線的粗細(xì)，可以理解為關(guān)聯(lián)的強(qiáng)度
R數(shù)據(jù)可視化18:弧形圖
每次有正事的時(shí)候就想逃避寫個(gè)簡書，假裝自己沒有干不正經(jīng)的事。（明明我還有一些數(shù)據(jù)需要分析呢，但是毫無分析的動(dòng)力。）好的，今天我們來介紹一個(gè)很酷炫的圖：弧形圖（Arc Diag...
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@Tarim_Med 不是大佬 哈哈哈所以已經(jīng)很久沒有更新了
我想做個(gè)理想主義者
昨天（6.17）是一年一度的生日。一如既往，要進(jìn)行一番自我思考、自我剖析。 緣分妙不可言 本科畢業(yè)4年，碩士畢業(yè)1年，9月即將正式入學(xué)讀生物博士。8年前，高考結(jié)束的那一刻，我...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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@vv2020 質(zhì)控后 不過現(xiàn)在二代測序比較成熟 測序質(zhì)量都比較高 可能質(zhì)控前后差別也不會(huì)太大
RNA-seq: Kallisto+Sleuth(1)
本文我們來簡單介紹一下非?？旖莺糜玫囊粋€(gè)RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推薦的原因是其速度非?？?，在我的Mac Pro就可以運(yùn)行使用，而且其結(jié)果也比...
個(gè)人介紹
本科畢業(yè)于浙江大學(xué)，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)，浙大讀博ing。
如果沒有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
如果沒有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com