在進(jìn)行差異基因表達(dá)分析時(shí),得到顯著差異基因后,接下來(lái)就需要分析這些基因參與了哪些功能,常見(jiàn)的就是GO功能注釋和KEGG通路富集分析,今天為大家介紹在線分析工具的使用——DAV...
在進(jìn)行差異基因表達(dá)分析時(shí),得到顯著差異基因后,接下來(lái)就需要分析這些基因參與了哪些功能,常見(jiàn)的就是GO功能注釋和KEGG通路富集分析,今天為大家介紹在線分析工具的使用——DAV...
落在一個(gè)人一生中的雪,我們不能全部看見(jiàn)。 我突然想起了一個(gè)詞 -- 感同身受。事實(shí)上,這明顯是沒(méi)人能過(guò)做到。但一直讓人不明白的,或許是這個(gè)詞,又為什么存在? 沒(méi)有人能做到感同...
轉(zhuǎn)眼間,又到了畢業(yè)季。昨天晚上熊分享了他跟高富帥發(fā)小的聊天心得,總結(jié)工作與讀博的相似之處和不容易。今天下午聽(tīng)了宋立榮老師和甘南琴老師的兩個(gè)學(xué)生的博士答辯,頗感不易,其中酸甜苦...
劉小澤寫(xiě)于19.2.17依然是很容易上手的小工具得到了組裝的轉(zhuǎn)錄本,就可以根據(jù)這個(gè)去找潛在的生物學(xué)相關(guān)信息,比如編碼區(qū)預(yù)測(cè)、注釋等 利用TransDecoder 這個(gè)工具可以...
對(duì)于非模式生物或者無(wú)參考基因組的項(xiàng)目,經(jīng)常需要進(jìn)行基因的功能注釋,而GO注釋是基因功能注釋的重要部分。有很多軟件能夠獲得GO注釋的信息,例如interproscan、eggn...
R markdown功能多多 可以用網(wǎng)頁(yè)HTML、PDF、Word等多種展示方式。做presentation非常有用,文件小,內(nèi)容大。最近我想做一個(gè)R Markdown寫(xiě)一些...
按我前面文章繼續(xù)反思:如何才能入門(mén)生信?中提到的學(xué)習(xí)方案執(zhí)行。 總的方案: 孟老師推薦關(guān)于最后一部分的四大切入點(diǎn),最后是把幾個(gè)不同的Seq的過(guò)程細(xì)節(jié)都了解一下。 第一部分:l...
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 富集分析軟件由于做的材料不是模式植物,用clusterProfiler上面配置起來(lái)有點(diǎn)困難,最要命的是基因組數(shù)據(jù)庫(kù)并沒(méi)有上傳NCBI,無(wú)法用OrgDb,當(dāng)然也可以自...