寫在前面 年初在汕頭婚宴上，我問一個(gè)朋友，現(xiàn)在在做什么工作。他回復(fù)了我： 但行好事，莫問前程。 現(xiàn)在看來，挺好。 構(gòu)建進(jìn)化樹的基礎(chǔ)是序列對齊，或者說多序列比對。做序列對齊的主...
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快速修剪-多序列比對結(jié)果-構(gòu)建靠譜的進(jìn)化樹 -
awk的三種方法將基因fa或蛋白fa序列文件由多行轉(zhuǎn)換為一行示例fa文件： 第一種方法： 新建 script.sh，輸入以下內(nèi)容： 第二種方法： 只需一行awk命令（閑來無事突然想出來的騷操作）： 之后運(yùn)行，第一個(gè)參數(shù)為需要轉(zhuǎn)換的多行...
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植物啟動(dòng)子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測-可視化分析寫在前面 以前總看到問題是，基因結(jié)構(gòu)可視化的問題；現(xiàn)在則變成了啟動(dòng)子元件的預(yù)測或者說可視化。這本身比較簡單，也比較玄乎，所以我一直不是太樂意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng)，手上的...
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如何在NCBI批量下載基因家族序列？在做生信下游基因分析的時(shí)候，我們通常需要下載興趣基因的序列信息構(gòu)建進(jìn)化書什么的，如果興趣基因比較少，那么可以直接在NCBI上搜索這個(gè)基因下載序列。但如果興趣基因很多，如果逐個(gè)...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個(gè)胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
