2021-06-26 一. 為什么要做基因組Survey? Survey分析要做什么數(shù)據(jù)準(zhǔn)備?(1)QC方法介紹(2)NT方法介紹 1.為什么要進(jìn)行Survey分析?2.Su...
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最近一直在折騰結(jié)構(gòu)變異SV的鑒定,SV的鑒定軟件雖然很多,但是在最近的兩篇基因組文章里面,主要用的是smartie-sv和bayesTyper,其中smartie-sv主要用...
之前call snp 都是用samtool mpileup 以及bcftools view進(jìn)行,但是版本更新忒快,故現(xiàn)在可直接使用bcftools mpileup 以及 bc...
2020年3月8日,這幾天我的心情很不好。又或是今天,3月8日。原先的婦女節(jié),在現(xiàn)在被叫做女神節(jié)。是呀,又是節(jié)日,心生不快,因?yàn)?,我眼前的這個(gè)人,很少很少會(huì)主動(dòng)送我禮物,更是...
現(xiàn)有比對(duì)工具在做mapping之前,都需要下載對(duì)應(yīng)物種的參考基因組做index,而如何選擇合適的參考基因組是一件非常重要的事情。 現(xiàn)有的參考基因組存儲(chǔ)網(wǎng)站三個(gè): UCSC 的...
生物信息學(xué)分析和作圖是科研狗們的必備技能。近幾年,隨著數(shù)據(jù)類型的增多,excel、SPSS等常用軟件已經(jīng)不能滿足科研需求了。R語(yǔ)言以其方便、快捷的優(yōu)勢(shì),迅速獲得許多編程技術(shù)不...