什么是tibble 簡而言之tibble是data.frame的一種形式，語法和data.frame較為相似，其實大部分功能都與data.frame相似。tibble來自于t...
發(fā)簡信
IP屬地：新疆
-
R tibble簡介 -
R語言pheatmap熱圖色條控制小技巧本期介紹一個控制熱圖顏色范圍并規(guī)定指定值顏色的小技巧。 使用的是R語言的pheatmap包，先生成隨機數(shù)據(jù)： data1如下： 查看數(shù)據(jù)范圍： 使用上面的矩陣做熱圖，要求低值...
-
[解決]Origin繪圖 y 軸不按順序排列問題前言 首先這里的Origin是不是EA公司游戲發(fā)布平臺哈。Origin是由OriginLab公司開發(fā)的一個科學繪圖、數(shù)據(jù)分析軟件，支持各種各樣的2D/3D圖形。這個款軟件上手...
-
Exome-seq、ChIP-seq、RNA-seq之間的差異
本文轉自沈夢圓的博客 全外顯子測序是啥？轉錄組測序是啥？轉錄組測序又是啥？他們之間有什么差別么？傻傻分不清，不用怕，多學習下就會了，下面讓我們一起來看看！ 1 溫基礎測序深度...
-
VMware 虛擬機無法連接網(wǎng)絡解決辦法VMware中創(chuàng)建的虛擬機無法連接網(wǎng)絡時，解決方案如下： 1.首先確保自己的物理機的網(wǎng)絡是連通的，在這里不多做介紹。 2. 點擊VMware[https://so.csdn....
-
ggplot2分面作圖然后在其中一個添加注釋ggplot2分面作圖如果添加注釋通常在每一個小圖都會添加上比如 如果我只想在第一個小圖添加一個注釋該如何實現(xiàn)呢？經(jīng)過搜索找到的辦法基本都是為添加注釋重新準備單獨的一份數(shù)據(jù) ...
-
個人向ggplot2箱線圖總結主要從如何看圖、用圖與作圖三個方面來對箱線圖進行理解和總結。 1、看圖 如圖所示，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進行繪制的，包含6個數(shù)據(jù)節(jié)點，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣、上...
-
SCAN | 查看基因的eQTL及SNP是哪些基因的eQTL簡介 該數(shù)據(jù)庫包含針對SNP（人類）的兩類注釋內(nèi)容： 基于位置關系，給出該SNP位于基因哪個區(qū)域（如intronic, intergeni, etc）。如果該SNP與某基因的...
-
R語言-相乘&相加交互作用計算的兩種方法方法一 基于R包epiR: Tools for the Analysis of Epidemiological Datahttps://cran.r-project.org/...
-
z-score公式錯了哦：
z-score=(up-down)/sqrt(count)富集分析圈圈圖
0.需求解讀 這是富集分析比較常見的一個圖，左圖右表。 圖的最外層是GOterm的編號，中間灰色背景層表示基因的logFC分布，可以看到每個term對應到的市上調(diào)基因還是下調(diào)...
-
將AI中的對象復制到ppt編輯
選中AI中的對象 ctrl+C復制 打開ppt ctrl+alt+V選擇 “圖片（增強型圖元文件）“ 粘貼（目前嘗試發(fā)現(xiàn)需要用office，WPS不行） 在ppt中選中粘貼的...
-
怎樣在imageJ中扣除/添加部分選擇區(qū)域
扣除區(qū)域： 用方框、圓形、自由選擇或者魔棒選擇目標區(qū)域（tips:魔棒工具圖標雙擊可以調(diào)整選擇閾值） 按ctrl+T，或者點擊edit-selection-add to ma...
-
Logistic回歸分析時幾個需要注意的問題
1、關于樣本含量的問題 logistic回歸分析中，到底樣本量多大才算夠，這一直是個令許多人困惑的問題。盡管有的人從理論角度提出了logistic回歸分析中的樣本含量估計，但...
-
使用clusterProfiler進行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一、...
-
ComplexHeatmap繪制復雜熱圖pheatmap交互 最近ComplexHeatmap更新可以將pheatmap對象進行參數(shù)轉換。新增的ComplexHeatmap::pheatmap()的功能與pheat...
-
統(tǒng)計學4-辛普森悖論對撞因子 對撞因子（Collider）【1】，在統(tǒng)計學和圖模式中，是指同時被兩個以上的變量影響的變量，而這些影響對撞因子的變量之間不一定有因果關系。因為在環(huán)路圖上會顯示為有兩...
-
【R語言小技巧】怎樣創(chuàng)建行數(shù)為0的數(shù)據(jù)框
1.用data.frame() 2.先創(chuàng)建矩陣，再轉換為數(shù)據(jù)框 該方法的優(yōu)勢是，當列數(shù)很多的時候創(chuàng)建比較方便
-
GO和Pathway富集分析的背景基因集
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析時，都會涉及到 Background; 做分析時，分析工具會提供一些數(shù)據(jù)供使用者選擇或者使用自定義的gene list。 例如，...
-
【轉錄組學】featureCounts軟件中的length是怎樣計算的？
分析過程 以rela基因為例，featureCounts結果文件“all.id.txt”中提供的信息為： 接下來用R語言進行分析:1. 提取featureCounts結果中的...