@xwl123 grep "^name:" go-basic.obo | awk -F ': ' '{print $2}' > GO.name
以冒號和空格做分隔符就可以了
比較基因組學分析3：特異節(jié)點基因家族富集分析（非模式物種GO/KEEG富集分析）比較基因組學分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計算分化時間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴張分析[ht...
確實，這樣會導致description列只有一個單詞，最后作氣泡圖導致有重復的列
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在注釋庫構(gòu)建的第一步里，grep "^name:" go-basic.obo |awk '{print $2}' > GO.name ，最好不要直接print $2，這樣會導致只有一個單詞進入GO.class中，可以直接sed掉name:
請問下4.4步驟KEGG注釋生成中的命令：
gene2pathway <- gene2ko %>% left_join(ko2pathway, by = "KO") %>%
dplyr::select(GID, Pathway) %>%
na.omit()
會報如下錯誤：
Error in is.data.frame(y) : object 'ko2pathway' not found
請問下是怎么解決的......??
比較基因組學分析3：特異節(jié)點基因家族富集分析（非模式物種GO/KEEG富集分析）比較基因組學分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計算分化時間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴張分析[ht...
你這個gtf文件格式介紹不對，第三列是feature，例子給的也完全不對
基因組注釋文件（二）| gff 和 gtf文件格式說明簡介 GFF和GTF是兩種最常用的基因組注釋格式，在信息分析中建庫時除了需要fasta文件一般還會需要這兩種文件，提取需要的信息進行注釋。 一、GFF GFF(General...
