發(fā)簡信
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2025-09-09-批量蛋白亞細胞定位分析指北責編：王采荷 近期遇到一個統(tǒng)計問題：通過親和純合/質(zhì)譜篩選出了很多互作蛋白，但是我很想知道這些蛋白在細胞內(nèi)的亞細胞位置，查閱了很多資料發(fā)現(xiàn)均需要...
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2024-04-18R語言讀取數(shù)據(jù)謹防特殊字符和羅馬字符等比如，我最近在讀取一個excel表格，里面的數(shù)據(jù)是這樣的，是代謝物的名稱： 如果我直接讀取的話 那么在R里就會出現(xiàn)這樣的情況圖二 上述情況很麻煩...
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如何用R語言做差異代謝物的kegg富集分析編寫：王采荷 感覺已經(jīng)很久沒有在簡書上分享自己的東西了，今天在集合其他大佬的力量終于把“如何用R語言做差異代謝物的kegg富集分析”這個問題給解...
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如何上傳測序數(shù)據(jù)至CNGBdb數(shù)據(jù)庫——以宏基因組測序數(shù)據(jù)為例一、Aspera軟件下載 首先是CNGBdb網(wǎng)站：https://db.cngb.org/[https://db.cngb.org/]圖一 當然...
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BPGA--細菌泛基因組分析軟件包經(jīng)歷過OrthoMCL軟件包安裝的艱辛（然而，終究也沒安裝成功），就知道轉(zhuǎn)而用BPGA包是有多么香了。話不多說，來看看BPGA是如何安裝且使用的...
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下載微生物16S rDNA序列并用MEGA-X構(gòu)建進化樹整理：王采荷 一、下載同一種屬不同species下的微生物16S rDNA 使用NCBI網(wǎng)站：https://www.ncbi.nlm.nih....
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Windows本地安裝blast軟件并簡單比對分析整理：dayueban 主要目的是方便日常對測序數(shù)據(jù)，如編碼某個蛋白的基因在物種間序列上的相似性比較。 一、軟件下載和安裝 blast軟件網(wǎng)址：...
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新型冠狀病毒序列構(gòu)建進化樹編譯：王采荷 關于進化樹（系統(tǒng)發(fā)育進化樹，Phylogenetic tree），一般也叫作系統(tǒng)進化樹它的用途我這里就不在贅述了。因為遠的不說，就...
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ggplot2 | 如何將菌群分類數(shù)據(jù)作面積圖導讀 菌群分類數(shù)據(jù)的可視化，包括豐度在個體之間以以及組間的一個比較怎么生動形象，一直是我想解決的問題，今天看到一篇文章上面用的是ggplot2包...