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R機器學(xué)習(xí)mlr3：超參數(shù)調(diào)優(yōu)
很多人戲稱調(diào)參的過程就像是"煉丹"！確實差不多，而且很多時候你調(diào)整后的結(jié)果可能還不如默認(rèn)的結(jié)果好！這就好比打游戲，"一頓操作猛如虎，一看戰(zhàn)績0比...
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R機器學(xué)習(xí)mlr3：模型評價和比較
前面一篇介紹了如何使用mlr3創(chuàng)建任務(wù)和學(xué)習(xí)器、擬合模型、預(yù)測和簡單的評價，本篇將模型評價的一些細(xì)節(jié)問題，展示mlr3如何使得這些步驟變得更加簡...
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新版TCGA的突變SNP數(shù)據(jù)下載和整理關(guān)于TCGAbiolinks包的學(xué)習(xí)前面一共介紹了5篇推文。 今天繼續(xù)學(xué)習(xí)如何使用TCGAbiolinks下載和整理MAF格式的突變數(shù)據(jù)。 之前...
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新版TCGA表達(dá)矩陣整理簡單版很多人因為網(wǎng)絡(luò)原因不能使用TCGAbiolinks這個神包下載TCGA的RNA-seq數(shù)據(jù)，只能通過瀏覽器訪問GDC TCGA的官網(wǎng)進(jìn)行下載，而...
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TCGA新版數(shù)據(jù)差異分析上一篇文章里面簡單學(xué)習(xí)了一下表達(dá)矩陣的提取，順便探索了一下SummarizedExperiment對象。 今天學(xué)習(xí)下用TCGAbiolinks做...
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R語言方差分析本文首發(fā)于公眾號：醫(yī)學(xué)和生信筆記，完美觀看體驗請至公眾號查看本文。醫(yī)學(xué)和生信筆記，專注R語言在臨床醫(yī)學(xué)中的使用，R語言數(shù)據(jù)分析和可視化。 這是R...
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決策曲線分析DCA用于lasso回歸/隨機森林本文首發(fā)于公眾號：醫(yī)學(xué)和生信筆記 醫(yī)學(xué)和生信筆記，專注R語言在臨床醫(yī)學(xué)中的使用，R語言數(shù)據(jù)分析和可視化。主要分享R語言做醫(yī)學(xué)統(tǒng)計學(xué)、meta分析...
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R語言t檢驗本文首發(fā)于公眾號：醫(yī)學(xué)和生信筆記 醫(yī)學(xué)和生信筆記，專注R語言在臨床醫(yī)學(xué)中的使用，R語言數(shù)據(jù)分析和可視化。主要分享R語言做醫(yī)學(xué)統(tǒng)計學(xué)、meta分析...