一條小咸魚
IP屬地：福建
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線粒體基因組的組裝和注釋（MitoFinder ）
之前有過用二代測(cè)序的數(shù)據(jù)組裝植物葉綠體基因組昆蟲線粒體的經(jīng)歷，用的是單位的超算（Linux系統(tǒng)）。 這里的二代測(cè)序數(shù)據(jù)是全基因組的淺層測(cè)序數(shù)據(jù)，因?yàn)槿~綠體和線粒體是多拷貝的，...
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復(fù)旦大學(xué)研究生在讀，方向：神經(jīng)疾病，基因組學(xué)，郵箱：shiyuant@outlook.com，文章完整系列個(gè)人主頁：tongshiyuan.github.io
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來的流程 ?? ?? ??
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PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop<br>
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質(zhì)控，組裝，預(yù)測(cè)，注釋，比較，進(jìn)化一條龍
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生信博客學(xué)習(xí)資源記錄（長(zhǎng)期更新：2022.5.25）主要記載一些生信大佬們的博客地址，以供學(xué)習(xí)與查詢。我常用的一些博客、論壇，在這里沒有記錄，因?yàn)榻?jīng)常用，記得住。大家自己搜索下，生信技能樹、生信菜鳥團(tuán)、陳連福老師的博客和bio...
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轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控）
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（reads的比對(duì)與samtoo...
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《覺醒時(shí)代》<br>
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MegaX 軟件繪制進(jìn)化樹
羅列一些比較好的教程 科研星球，如何用MEGA-X構(gòu)建進(jìn)化樹[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]。 百邁課，系統(tǒng)進(jìn)化樹介紹及繪制...
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MEGA7使用簡(jiǎn)介MEGA（Molecular Evolutionary Genetics Analysis）是一個(gè)非常強(qiáng)大的分子進(jìn)化遺傳分析軟件，可用于序列比對(duì)、進(jìn)化樹推斷、估計(jì)分子進(jìn)化速度...
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理性看世界。。。
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分享生信知識(shí)。全網(wǎng)同名，有問題搜索工種昊留言??
