這里是佳奧！新的一年，ATAC-Seq的學(xué)習(xí)也進(jìn)入了尾聲。 讓我們開始吧！ 1 peaks注釋 統(tǒng)計(jì)peak在promoter，exon，int...
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【ATAC-Seq 實(shí)戰(zhàn)】五、peaks、motif注釋 -
基因功能富集調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析--FGNetFGNet介紹 ??FGNet（Functional Gene Networks derived from biological enrichm...
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基因組學(xué)（課程筆記）-- 泛基因組泛基因組（Pangenome）：指的是某一物種全部基因的集合 （A Pangenome refers to a collection of ge...
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ChIP-Seq——MAnorm差異分析
一、 MANorm介紹 MAnorm是一個穩(wěn)健的模型，用于定量比較 TF（轉(zhuǎn)錄因子）或表觀遺傳修飾的 ChIP-Seq 數(shù)據(jù)集。MAnorm 使...
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linux版本mrbayes和iqtree跑多基因樹基本思路就是利用phylosuite軟件下載序列，串聯(lián)尋找mrbayes和iqtree軟件的模型，然后用多線程的mrbayes和iqtree跑樹...
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MetaPhlAn4 Meta taxonGithub: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaPhlAn-4[https://...
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11.GWAS：確定候選區(qū)間
確定了與表型顯著的SNP位點(diǎn)后，通常會選擇在顯著性位點(diǎn)所在位置前后，各一定的距離內(nèi)，確定候選區(qū)間，進(jìn)行候選基因挖掘，而這個距離如何確定？9.5 ...
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Multi-omics Hammer軟件之fasta格式整理和保守結(jié)構(gòu)域查找上一篇推文主要介紹了一下Multi-omics Hammer軟件的Aligment功能，本篇就接著上一篇推文繼續(xù)介紹如何使用該軟件進(jìn)行fasta...
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dotPlotly 比較兩個不同組裝的效果可視化dotPlotly[https://github.com/tpoorten/dotPlotly]工具，是利用Ｒ語言寫的可視化Minimap...
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高效繪圖小工具：Multi-omics Visual對于科研人員而言，很好的展現(xiàn)數(shù)據(jù)是工作中的必要技能，圖最為可視化的最主要形式是最為簡單直接的一種表現(xiàn)方式。但是如何繪制精美的圖片則一直是個...
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