發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：安徽
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LncRNA專題 | lncRNA的鑒定和靶基因預(yù)測(cè)前言 lncRNA產(chǎn)品系列上篇介紹了lncRNA的富集和高通量測(cè)序，重點(diǎn)闡述了如何針對(duì)lncRNA的結(jié)構(gòu)特征，采用合適的富集方法盡可能多地富集到lncRNA，并在其后的實(shí)驗(yàn)操...
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山羊選擇相關(guān)基因
1Yuan Y, Zhang W, Liu C, He Y, Zhang H, Xu L, Yang B, Zhao Y, Ma Y, Chu M et al: Genome...
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轉(zhuǎn)載---[轉(zhuǎn)錄組] 用qPCR驗(yàn)證RNA-Seq挑多少個(gè)基因合適？做完RNA-Seq測(cè)序之后，往往會(huì)用QPCR來(lái)驗(yàn)證一下結(jié)果。 因?yàn)镽NA-Seq測(cè)序數(shù)據(jù)得到的結(jié)果作為定量參考，參數(shù)的改變也會(huì)造成結(jié)果的不同。所以需要進(jìn)行qPCR驗(yàn)證，表達(dá)水...
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生信步驟|轉(zhuǎn)錄組mRNA數(shù)據(jù)的有參組裝轉(zhuǎn)錄組的組裝能夠提供豐富的組學(xué)信息，是生物信息學(xué)中重要的基礎(chǔ)步驟。測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)過(guò)濾，比對(duì)，排序，組裝，最終得到轉(zhuǎn)錄本的全部序列信息。下面我們以稻瘟菌測(cè)序數(shù)據(jù)SRR081...
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使用R語(yǔ)言進(jìn)行樣本相關(guān)性、聚類分析
1.導(dǎo)入三張表（表達(dá)矩陣、樣本信息表、基因信息表） 1.1 表達(dá)矩陣 都是有兩種導(dǎo)入方法，這里只交代代碼導(dǎo)入 1.2 樣本信息表 需要注意的是，樣本信息表中的行名一定一定要與...
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請(qǐng)問(wèn)我數(shù)據(jù)量大，服務(wù)器的代碼有嗎，想學(xué)習(xí)一下
WGCNA分析 | 全流程分析代碼 | 代碼一
注意：今天的教程比較長(zhǎng)，請(qǐng)規(guī)劃好你的時(shí)間。本文是付費(fèi)內(nèi)容，在本文文末有本教程的全部的代碼和示例數(shù)據(jù)。 輸出結(jié)果 分析代碼 關(guān)于WGCNA分析，如果你的數(shù)據(jù)量較大，建議使用服務(wù)...
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WGCNA
WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程
本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多。 WGC...
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請(qǐng)問(wèn)一下，我前面上機(jī)測(cè)序后，拿到clean date，已經(jīng)進(jìn)行了一遍參考基因組比對(duì)，拼接，合并，定量，定量過(guò)程中我選擇的是原有的gtf文件，但是我現(xiàn)在想做lncRNA分析，是不是可以理解為，我只需要用合成的merge.gtf做一遍定量，然后接著往下走就可以了
lncRNA分析
處理原始數(shù)據(jù)文件 rawdata質(zhì)控 統(tǒng)計(jì)cleandatabase 建立索引 hisat2比對(duì) 排序 統(tǒng)計(jì)比對(duì)率 stringTie組裝 合并轉(zhuǎn)錄本 定量 ballgrow...
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中科院遺傳發(fā)育所在讀博士，研究水稻。關(guān)注植物免疫和群體遺傳進(jìn)化，經(jīng)常摸魚學(xué)生信。同名CSDN分享代碼，歡迎圍觀~
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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