全文分析流程學(xué)習(xí)按照：九月學(xué)徒ChIP-seq學(xué)習(xí)成果展 一、 怎么將SAR文件轉(zhuǎn)為fastq文件？ 1. 【方法】利用軟件sratoolkit，下載后解壓，找到其中的 f...
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Chip-Seq 分析過程二 -
如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動子和增強子
一、表觀遺傳學(xué)的組蛋白修飾 染色體一個核小體由兩個H2A，兩個H2B，兩個H3，兩個H4組成的組蛋白八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成。組蛋白有很多修飾形式，包括組蛋白...
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超詳Chip-seq分析流程一、Chip-seq分析流程 二、數(shù)據(jù)、參考基因組、所需軟件下載 1、參考基因組下載： 以二穗短柄草為例： https://genome.jgi.doe.gov/portal...
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數(shù)據(jù)分析：基于DESeq2結(jié)果的基因富集分析介紹 DESeq2常用于識別差異基因，它主要使用了標(biāo)準(zhǔn)化因子標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)，再根據(jù)廣義線性模型判別組間差異（組間殘差是否顯著判斷）。在獲取差異基因結(jié)果后，我們可以進(jìn)行下一步的富集...
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TCGA 數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn) —— 富集分析前言 通常，在識別完了差異基因之后，都會對差異基因進(jìn)行功能富集，來獲取差異基因參與的潛在生物學(xué)功能通路或生物學(xué)進(jìn)程，有助于理解基因之間的作用關(guān)系以及發(fā)現(xiàn)基因在癌癥發(fā)生發(fā)展過程...
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【文獻(xiàn)解讀】揭秘發(fā)4.8分生信論文的套路以下小編分享一篇今年8月25日發(fā)表在《Aging》的原著性文章，標(biāo)題是Characterization of long non-coding RNA and messenge...
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如何把文獻(xiàn)PDF導(dǎo)入EndNote說到EndNote，大家一定不會覺得陌生，之前小博給大家介紹過EndNote的基礎(chǔ)使用方法（忘記的小伙伴們可以復(fù)習(xí)一下~）今天小博給大家介紹的是如何把文獻(xiàn)PDF導(dǎo)入EndNo...
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CRISPR-Cas9基因編輯2--gRNA設(shè)計（下）簡介和前期文章 我對之前的所有教程進(jìn)行了再次詳細(xì)的總結(jié)CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設(shè)計（上） 前言： 在上一次文章中，我們已經(jīng)得到了在線工具設(shè)計的sgR...
