發(fā)簡信
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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您好，請(qǐng)問 怎么讀取這個(gè)數(shù)據(jù)進(jìn)去呢？？BW格式的：ATAC1084.mm10.片段.rpm.bw
ArchR官網(wǎng)教程學(xué)習(xí)筆記1：Getting Started with ArchR
前面的學(xué)習(xí)筆記里，對(duì)于scATAC-seq的分析，使用的是signac R包進(jìn)行的。前幾天在一次偶然的機(jī)會(huì)里，有幸和一個(gè)專門做生信的老外聊了聊（紐約某校的PI），從他那里聽說...
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單細(xì)胞分群——T細(xì)胞的markers
調(diào)節(jié)性T細(xì)胞 調(diào)節(jié)型T細(xì)胞（Treg）細(xì)胞激活信號(hào) TNFRSF9 (4-1BB) # PMID: 35121991 CD8+ T細(xì)胞 耗竭型T細(xì)胞（Tex）PDCD1，C...
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這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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請(qǐng)問各位大佬，怎么自己調(diào)整AUC閾值，然后作圖呢？？
AUCell：在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中識(shí)別細(xì)胞對(duì)“基因集”的響應(yīng)
使用AUCell識(shí)別單細(xì)胞rna數(shù)據(jù)中具有活性“基因集”(i.e. gene signatures)的細(xì)胞。AUCell使用“曲線下面積”(Area Under the Cu...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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小白初學(xué)R（day1）——從單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析開始不積跬步無以至千里 安裝R語言，工欲善其事，必先利其器，作為生信小白，安裝R語言也走了不少彎路，要注意R語言和RStudio是搭配安裝的哦 詳情見網(wǎng)址“https://blo...
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傳說中的 “bio生物信息” 首席編輯
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周運(yùn)來，男，長大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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生信技能樹新葉講師<br>這里是新葉的分身馬甲：信你個(gè)鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>歡迎學(xué)習(xí)交流
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捋一捋---活化的CD4 T cell 都有哪些亞型一：什么是CD4、什么是CD4T cell、什么是Actived CD4 T cell? CD4，屬于免疫球蛋白超家族的成員，主要表達(dá)于大部分胸腺細(xì)胞、T細(xì)胞亞群，在巨噬細(xì)胞...
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2022-03-07：substr函數(shù)在TCGA數(shù)據(jù)中提取樣本信息1：了解substr函數(shù)（截取函數(shù)），從start位置開始提取字符串，示例如下 2：用substr函數(shù)在TCGA數(shù)據(jù)中提取樣本信息 tumor <- colnames(exp...
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遺傳學(xué) 博士
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使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一、...
