您好,請(qǐng)問 怎么讀取這個(gè)數(shù)據(jù)進(jìn)去呢??BW格式的:ATAC1084.mm10.片段.rpm.bw
ArchR官網(wǎng)教程學(xué)習(xí)筆記1:Getting Started with ArchR前面的學(xué)習(xí)筆記里,對(duì)于scATAC-seq的分析,使用的是signac R包進(jìn)行的。前幾天在一次偶然的機(jī)會(huì)里,有幸和一個(gè)專門做生信的老外聊了聊(紐約某校的PI),從他那里聽說...
調(diào)節(jié)性T細(xì)胞 調(diào)節(jié)型T細(xì)胞(Treg)細(xì)胞激活信號(hào) TNFRSF9 (4-1BB) # PMID: 35121991 CD8+ T細(xì)胞 耗竭型T細(xì)胞(Tex)PDCD1,C...
請(qǐng)問各位大佬,怎么自己調(diào)整AUC閾值,然后作圖呢??
AUCell:在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中識(shí)別細(xì)胞對(duì)“基因集”的響應(yīng)使用AUCell識(shí)別單細(xì)胞rna數(shù)據(jù)中具有活性“基因集”(i.e. gene signatures)的細(xì)胞。AUCell使用“曲線下面積”(Area Under the Cu...
不積跬步無以至千里 安裝R語言,工欲善其事,必先利其器,作為生信小白,安裝R語言也走了不少彎路,要注意R語言和RStudio是搭配安裝的哦 詳情見網(wǎng)址“https://blo...
一:什么是CD4、什么是CD4T cell、什么是Actived CD4 T cell? CD4,屬于免疫球蛋白超家族的成員,主要表達(dá)于大部分胸腺細(xì)胞、T細(xì)胞亞群,在巨噬細(xì)胞...
1:了解substr函數(shù)(截取函數(shù)),從start位置開始提取字符串,示例如下 2:用substr函數(shù)在TCGA數(shù)據(jù)中提取樣本信息 tumor <- colnames(exp...
clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包,看過了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔,加上了我的測試數(shù)據(jù)(還是以果蠅為例)。 一、...