上篇學習了如何用Gephi繪制網(wǎng)絡(luò)圖，今天學習做個復(fù)雜點，一看就讓人覺得是高水平文章的“上流”的網(wǎng)絡(luò)圖，學習繪制下面這個櫻花圖。 下面是這個圖的原始數(shù)據(jù)的edge文件： 和上...
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【網(wǎng)絡(luò)圖】繪制"上流"的網(wǎng)絡(luò)圖 -
DisGeNET：整合了與人類疾病相關(guān)基因和突變信息的綜合數(shù)據(jù)庫1##導(dǎo)語 DisGeNET是人類疾病相關(guān)最大基因和突變微店數(shù)據(jù)庫之一。 DisGeNET集成了來自專家管理的存儲庫，GWAS目錄，動物模型和科學文獻的數(shù)據(jù)。 可通過Web界...
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生物節(jié)律之衰減晝夜節(jié)律計算：circacompare使用篇（6）最近在進行l(wèi)umicycle實驗，接觸到了細胞上面的衰減的晝夜節(jié)律。關(guān)于這一點，和動物造模有所不同，在細胞上面，由于細胞過于密集+培養(yǎng)時長延長+培養(yǎng)基介質(zhì)長期不更換的因素，細...
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Tax4Fun2 16s擴增子群落功能預(yù)測 使用小結(jié)
Tax4Fun2是一個基于16S rRNA數(shù)據(jù)集預(yù)測微生物群落功能的R包，是Tax4Fun的升級版本。其發(fā)布在Github項目bwemheu / Tax4Fun2[https...
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3.R運行前準備——ProjectR對象 有時候你需要放下正在做的R工作，在其它時間來接著分析；或者要同時進行多個分析，這些分析都使用 R，并且您希望將它們分開；要處理這些現(xiàn)實生活中的情況，您需要做出兩個決定...
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寶藏R包tinyarray：常用圖表一鍵收走最近抽空整理了以前寫的函數(shù)，規(guī)范tinyarray包，反復(fù)檢查和優(yōu)化，調(diào)整了好久，終于得到下面的check結(jié)果 今天把他提交到CRAN了(是提交不是接收哈，沒有那么快)整理了...
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如何進行變量篩選和特征選擇(二)？最優(yōu)子集回歸01 模型簡介 最優(yōu)子集回歸是多元線性回歸方程的自變量選擇的一類方法。從全部自變量所有可能的自變量組合的子集回歸方程中挑選最優(yōu)者。如m個自變量會擬合2m-1個子集回歸方程,...
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ggplot2繪制KEGG富集散點圖散點圖是 KEGG 富集分析結(jié)果的圖形化展示方式。在此圖中，KEGG 富集程度通過 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因個數(shù)來衡量。其中 rich ...
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R語言實戰(zhàn) | 新手福利~R語言程序包的安裝與使用"R實戰(zhàn)"專題·第1篇 編輯 | 科白君 本期推送內(nèi)容 R語言程序包的安裝與使用問題。編寫一份完整代碼時需要用到很多不同的函數(shù)，這意味著需要各種各樣的程序包。目前，R語言含有...
