不斷學(xué)習(xí)，不斷忘記，不斷回顧，不斷進(jìn)步，這便是凡人的學(xué)習(xí)方式,或謂曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.
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T 細(xì)胞組庫分析及多樣性和克隆性度量最近在做免疫組庫相關(guān)的東西,一邊看，一邊簡單翻譯一波，也是方便自己回顧，一遍簡單吐槽，丟在自己的筆記本里面也沒啥意思，有錯誤的就不管了，可以自己看原文 這是一篇綜述，主要講述...
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單細(xì)胞新藥研發(fā)導(dǎo)論|| 藥靶發(fā)現(xiàn)開刊詞||單細(xì)胞新藥研發(fā)導(dǎo)論[http://www.itdecent.cn/p/0008cc51ad86]單細(xì)胞新藥研發(fā)導(dǎo)論|| 新藥研發(fā)管線[https://www.ji...
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SCENIC是干啥的？
SCENIC是干啥的？ 【輸入】motif數(shù)據(jù)庫、單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù) 【輸出】regulons、每個細(xì)胞的regulon activity scores (RAS) 【...
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單細(xì)胞36計(jì)之32---單細(xì)胞進(jìn)行GSEA分析32、第三十二計(jì) 空城計(jì)在敵眾我寡的情況下，缺乏兵備而故意示意人以不設(shè)兵備，造成敵方錯覺，從而驚退敵軍之事。后泛指掩飾自己力量空虛、迷惑對方的策略。
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WGCNA分析，簡單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測序分析實(shí)戰(zhàn)班上，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多。 WGC...
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單細(xì)胞分析實(shí)錄(6): 去除批次效應(yīng)/整合數(shù)據(jù)
上一篇已經(jīng)講解了Seurat標(biāo)準(zhǔn)流程，推文的最后，注意到了不同樣本之間的表達(dá)數(shù)據(jù)是存在批次效應(yīng)的，就像下圖這樣，有些是可以聚到一起的亞群，卻出現(xiàn)了不同樣本分開/偏移的情況，比...
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周運(yùn)來，男，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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單細(xì)胞免疫組庫數(shù)據(jù)分析||Seurat整合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與VDJ數(shù)據(jù)在做10X單細(xì)胞免疫組庫分析的是往往是做一部分BCR、TCR做一部分5‘轉(zhuǎn)錄組，那么怎樣才能把兩者結(jié)合到一起呢？ 今天我們嘗試用我們的趁手工具做一下整合分析。 首先是下載數(shù)據(jù)...
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scRNA-seq擬時分析 || Monocle2 踩坑教程擬時（pseudotime）分析，又稱細(xì)胞軌跡（cell trajectory）分析，通過擬時分析可以推斷出發(fā)育過程細(xì)胞的分化軌跡或細(xì)胞亞型的演化過程，在發(fā)育相關(guān)研究中使用頻...
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單細(xì)胞軌跡推斷（Trajectory inference）分析（詳細(xì)代碼）練習(xí)需要的數(shù)據(jù)在這里下載：https://github.com/NBISweden/excelerate-scRNAseq/blob/master/session-traje...
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基于Seurat v3 object 從頭構(gòu)建 monocle的 CDS
文章轉(zhuǎn)自作者：阿糖胞苷鏈接：http://www.itdecent.cn/p/41372e039194來源：簡書簡書著作權(quán)歸作者所有，任何形式的轉(zhuǎn)載都請聯(lián)系作者獲得授權(quán)并注...
