%>%是管道符的意思，把左邊的輸出（不包括 <-之前的）當(dāng)成右邊的輸入。 怎么分辨是列表，還是向量，還是數(shù)組，還是矩陣，還是數(shù)據(jù)框？ 數(shù)組和矩陣和數(shù)據(jù)框有維度，dim()一下...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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R語(yǔ)言基礎(chǔ)匯總 -
遺傳多樣性軟件 Structure 使用說(shuō)明Structurestructure下載地址[https://web.stanford.edu/group/pritchardlab/structure.html] Stru...
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群體結(jié)構(gòu)推斷軟件FastStructure安裝的詳細(xì)指南
此款軟件是基于SNP位點(diǎn)進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)的推斷，運(yùn)行速度比較快一些，本文主要介紹它的詳細(xì)安裝步驟。一、安裝fastStructure的依賴包和庫(kù)：Cython，Scipy，Num...
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Mafft Trimal Fasttree建樹(shù)導(dǎo)讀 barrnap預(yù)測(cè)細(xì)菌基因組16S，獲取結(jié)果文件第二行最長(zhǎng)16S，保留>1400bp的16S。mafft做序列對(duì)齊。trimal修剪序列。fasttree建樹(shù)。ggtr...
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6. GWAS：主成分分析——GCTA利用協(xié)方差矩陣，特征值和特征向量將高緯變量投影到數(shù)個(gè)低維變量的過(guò)程； PCA分析的過(guò)程就是從千萬(wàn)級(jí)別的SNP位點(diǎn)中提取關(guān)鍵信息，以便使用更少的變量就可以對(duì)樣本進(jìn)行有效的刻畫(huà)和...
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Stacks Mac(RapidWeaver網(wǎng)頁(yè)制作插件)破解版Stacks是RapidWeaver的一個(gè)插件，允許您構(gòu)建將文本傳遞到主題維度的頁(yè)面，即使主題具有可變寬度。使用靈活的框架，您可以構(gòu)建流動(dòng)的列，靈活的行和圖像切片。您可以在列...
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非root權(quán)限下安裝vcftools并使用vcf-query
使用https://github.com/vcftools/vcftools下載的安裝包安裝時(shí)需要root權(quán)限，這時(shí)可以使用sourceforge中已編譯的包。 具體方法如下...
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ipyrad分析RAD數(shù)據(jù)（官網(wǎng)給出）的詳細(xì)操作步驟（入門(mén)級(jí)）序言：目前（截止2020.04.01），針對(duì)RAD-seq數(shù)據(jù)的分析軟件主要有伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校Catchen實(shí)驗(yàn)室的STACKS和哥倫比亞大學(xué)Deren Eato...
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stacks拆包RAD-seq過(guò)程中，process_radtags沒(méi)有自己需要的限制性內(nèi)切酶怎么辦？
酶切實(shí)驗(yàn)一共進(jìn)行了7組實(shí)驗(yàn)，并通過(guò)凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果，同時(shí)，最終得出最佳酶切組合為：MluCI + AvaII，用stacks軟件提供的process_radtags程序?qū)y(cè)序...
