下午打開Rstudio的時候發(fā)現(xiàn)圖形沒有出現(xiàn)在圖形框中，花了不少時間在解決這個問題，記錄一下下 解決方法1 根據(jù)這個方法https://zhuanlan.zhihu.com/...
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Error in RStudioGD() : Shadow graphics device error: r error 4 (Error in .External2(C_X11, pas... -
解決FileZilla連接時超時，無法連接服務器，且顯示fzSftp started, protocol version=11昨天使用FileZilla連接服務器，顯示fzSftp started, protocol version=11，無法連接服務器。 1. 先找出錯誤原因 因為我的是我自己用s...
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configure: error: Runtime link error linux安裝rjags找不到JAGS動態(tài)鏈接庫最近想用infercnv，然后我就安裝R包，會出現(xiàn)一個問題就是rjags安不上，問題checking version of JAGS library... link erro...
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biomaRt基因同源轉(zhuǎn)換時 使用中遇到Timeout was reached的解決辦法
根據(jù)之前別人po文中的代碼進行，發(fā)現(xiàn)行不通 出現(xiàn)了下面這樣子的報錯： 看了下bioconduct上管理員還是誰回復的說是近期biomaRt上有很多下載大量數(shù)據(jù)的人，導致速度變...
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解決RStudio Server: R is taking longer to start than usual
主要原因：當使用RStudio Server處理占內(nèi)存極大的數(shù)據(jù)后，長時間不清理內(nèi)存，不關閉rstudio，可能會產(chǎn)生此種問題，建議計算完畢后，盡快清理內(nèi)存。 當再次打開rs...
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讀《Computational-method-for-single-cell-data-analysis》跟著運來兄搭建自己的生物信息小書房。趁年輕，讀幾本硬書，到老了慢慢反芻。 如果讓我推薦一本比較全面的單細胞數(shù)據(jù)分析教材，我想會是《Computational-method-f...
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單細胞數(shù)據(jù)科學四大過程組兩大知識領域與三重境界很多朋友問是如何保持閱讀量的，其實，大部分是之前的存貨。有一部分是每有會意，把之前的舊書拿出來再翻一翻，做個導圖放上來的。今天，我想和大家分享一點最近對單細胞數(shù)據(jù)科學的理解，...
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使用MAESTRO整合分析scRNA和scATAC
Wang, C., Sun, D., Huang, X. et al. Integrative analyses of single-cell transcriptome a...
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使用lftp上傳數(shù)據(jù)到GEO，賊快！推薦我之前在2021年寫過上傳數(shù)據(jù)到GEO數(shù)據(jù)庫獲得GEO號[http://www.itdecent.cn/p/003ef56dd311]，那時候使用ncftpput上傳數(shù)據(jù)，...
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SCI文章寫作以及文章修稿的一點體會情感: 離上次寫筆記快半年之久了，這半年來基本都把心思花在了一個課題上。這兩日終于把文章修回去了，靜下來心來整理這個課題的結(jié)果，想著總結(jié)自己這半年來文章寫作以及文章修稿的一些...
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感謝，好棒呀，最近剛好需要這個?。?
如何給Seurat對象的基因重命名？【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27
適用背景 在單細胞分析中，必要的一步是對每個細胞進行注釋，這相當于給每個細胞打個標簽，或者說起個別名，這些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改細胞名字，S...
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clustree ： 聚類可視化利器我們知道在研究問題時，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術是聚類（clustering）...
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STRINGDB包的簡單使用String是一個很好的蛋白互作網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫，其不僅包含了直接物理作用的互作關系，還包含了蛋白之間以間接作用的互作關系。除了有實驗證據(jù)支持的數(shù)據(jù)外，還有整合其他數(shù)據(jù)庫中的互作數(shù)...
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R語言程序包開發(fā)
R語言程序包開發(fā)： 轉(zhuǎn)載自： 挑圈聯(lián)靠， 想提高文章的引用率？寫個R包吧！系列傳送門 01 必備工具 前言 R語言程序包是R語言的靈魂，是R語言的核心，每一個R語言用戶都會使...
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如何給Seurat對象的基因重命名？【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27
適用背景 在單細胞分析中，必要的一步是對每個細胞進行注釋，這相當于給每個細胞打個標簽，或者說起個別名，這些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改細胞名字，S...
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利用Linux下載阿里云以及諾禾云(諾禾致源)提供的測序數(shù)據(jù)早上在處理數(shù)據(jù)的時候，發(fā)現(xiàn)花的時間比預期多出一半，原本計劃45分鐘完成，花了一個半小時，當然啦，也有摸魚的水分在啦，哈哈哈哈，然后我想著還是整理出來一下數(shù)據(jù)下載流程，這樣方便...
個人介紹
愛生活愛學習愛運動的超級無敵鄭一一同學。偶爾郁悶，偶爾低沉，但大多數(shù)都是積極向上。慢慢學會認識自己的不足，坦然接受自己的平凡，努力去做好手頭上的工作，并慢慢去探尋自己喜歡并且熱愛的東西。如果我的一輩子注定平凡，那么希望自己享受著平凡而美好的生活