下午打開Rstudio的時候發(fā)現(xiàn)圖形沒有出現(xiàn)在圖形框中,花了不少時間在解決這個問題,記錄一下下 解決方法1 根據(jù)這個方法https://zhuanlan.zhihu.com/...
下午打開Rstudio的時候發(fā)現(xiàn)圖形沒有出現(xiàn)在圖形框中,花了不少時間在解決這個問題,記錄一下下 解決方法1 根據(jù)這個方法https://zhuanlan.zhihu.com/...
昨天使用FileZilla連接服務(wù)器,顯示fzSftp started, protocol version=11,無法連接服務(wù)器。 1. 先找出錯誤原因 因為我的是我自己用s...
最近想用infercnv,然后我就安裝R包,會出現(xiàn)一個問題就是rjags安不上,問題checking version of JAGS library... link erro...
根據(jù)之前別人po文中的代碼進行,發(fā)現(xiàn)行不通 出現(xiàn)了下面這樣子的報錯: 看了下bioconduct上管理員還是誰回復的說是近期biomaRt上有很多下載大量數(shù)據(jù)的人,導致速度變...
主要原因:當使用RStudio Server處理占內(nèi)存極大的數(shù)據(jù)后,長時間不清理內(nèi)存,不關(guān)閉rstudio,可能會產(chǎn)生此種問題,建議計算完畢后,盡快清理內(nèi)存。 當再次打開rs...
跟著運來兄搭建自己的生物信息小書房。趁年輕,讀幾本硬書,到老了慢慢反芻。 如果讓我推薦一本比較全面的單細胞數(shù)據(jù)分析教材,我想會是《Computational-method-f...
很多朋友問是如何保持閱讀量的,其實,大部分是之前的存貨。有一部分是每有會意,把之前的舊書拿出來再翻一翻,做個導圖放上來的。今天,我想和大家分享一點最近對單細胞數(shù)據(jù)科學的理解,...
Wang, C., Sun, D., Huang, X. et al. Integrative analyses of single-cell transcriptome a...
我之前在2021年寫過上傳數(shù)據(jù)到GEO數(shù)據(jù)庫獲得GEO號[http://www.itdecent.cn/p/003ef56dd311],那時候使用ncftpput上傳數(shù)據(jù),...
情感: 離上次寫筆記快半年之久了,這半年來基本都把心思花在了一個課題上。這兩日終于把文章修回去了,靜下來心來整理這個課題的結(jié)果,想著總結(jié)自己這半年來文章寫作以及文章修稿的一些...
感謝,好棒呀,最近剛好需要這個??!
如何給Seurat對象的基因重命名?【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27適用背景 在單細胞分析中,必要的一步是對每個細胞進行注釋,這相當于給每個細胞打個標簽,或者說起個別名,這些信息都存在@meta.data信息里,所以不用特意去更改細胞名字,S...
我們知道在研究問題時,分組是很重要的,有分組才有故事可講。比如,兩塊田一塊施肥一塊不施肥,可以做比較嘛。在單細胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類(clustering)...
String是一個很好的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫,其不僅包含了直接物理作用的互作關(guān)系,還包含了蛋白之間以間接作用的互作關(guān)系。除了有實驗證據(jù)支持的數(shù)據(jù)外,還有整合其他數(shù)據(jù)庫中的互作數(shù)...
R語言程序包開發(fā): 轉(zhuǎn)載自: 挑圈聯(lián)靠, 想提高文章的引用率?寫個R包吧!系列傳送門 01 必備工具 前言 R語言程序包是R語言的靈魂,是R語言的核心,每一個R語言用戶都會使...
適用背景 在單細胞分析中,必要的一步是對每個細胞進行注釋,這相當于給每個細胞打個標簽,或者說起個別名,這些信息都存在@meta.data信息里,所以不用特意去更改細胞名字,S...
早上在處理數(shù)據(jù)的時候,發(fā)現(xiàn)花的時間比預期多出一半,原本計劃45分鐘完成,花了一個半小時,當然啦,也有摸魚的水分在啦,哈哈哈哈,然后我想著還是整理出來一下數(shù)據(jù)下載流程,這樣方便...