這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長告別
發(fā)簡信
IP屬地：陜西
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你用Rstudio 和Rproj 就好了
Rmarkdown 設(shè)置工作目錄
Rmarkdown 怎么設(shè)置工作路勁 Rmarkdown里面setwd()沒用，個(gè)人感覺Rmarkdown里的路徑亂七八糟的，不知道自己的文件輸出到哪里去了，所以在使用Rma...
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Seurat取子集時(shí)會(huì)用到的函數(shù)和方法在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中，在確定細(xì)胞類型后，除了可以進(jìn)行差異表達(dá)基因分析外，還可以針對(duì)單個(gè)細(xì)胞類型進(jìn)行分析特定分析，這時(shí)就需要我們提取細(xì)胞子集分開處理了。 一、Seurat數(shù)據(jù)格式...
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每一個(gè)都得都是na是什么情況
將TCMSP 數(shù)據(jù)庫信息匹配uniprot
由于tcmsp 中選擇藥物靶點(diǎn)信息，給出的結(jié)果只有target name， 因此需要添加額外的gene symbol 信息。 從uniprot 中下載數(shù)據(jù)文件 因此首先下載u...
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免疫組庫系列-R包DivE的使用
中文應(yīng)該只有我寫了這個(gè)。。 “ DivE”估計(jì)量是一種啟發(fā)式方法，用于估計(jì)種群中的種類數(shù)量或物種數(shù)量(物種豐富度)。 文章 Quantification of HTLV-1 ...
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論文日鑒0-一些方法和代碼
隨緣記錄自己看到的一些文章文獻(xiàn)以及一些工具，又因?yàn)橹饕獌?nèi)容和生信可能比較相關(guān)，寫作隨緣，更新隨緣，故名緣信,過去的一周為第47周，為本刊第一周 文章 Temporal Dyn...
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咋不去看我的代碼??
爬蟲--R語言--基礎(chǔ)知識(shí)
爬蟲--R語言--代碼實(shí)戰(zhàn)（以豆瓣網(wǎng)站為例） - 簡書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/ac8154e1fa2c]爬蟲--R語...
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是的 視頻質(zhì)量非常高
轉(zhuǎn)錄組測序原理
參考： https://www.bilibili.com/video/BV1XJ411r7bJ/?spm_id_from=333.788.videocard.0 定義 而轉(zhuǎn)錄...
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Linux的parallel并行方法
我對(duì)于parallel并行的簡單理解即同時(shí)執(zhí)行多個(gè)命令語句。它與For循環(huán)語句的逐條運(yùn)行的思路大相徑庭。盡管目前很多生信軟件支持多線程運(yùn)行(一條命令語句內(nèi))，但并不是設(shè)置的越...
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你可以去NCBI 上查一下，可能是更換數(shù)據(jù)保存的鏈接了
全基因組分析實(shí)踐（參考：堿基礦工）
參考：堿基礦工從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上） 前言 由于人類基因組數(shù)據(jù)過大（我的小小服務(wù)器也只有50...
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@f15ec39b9fed 使用conda 安裝會(huì)方便很多。如果是自行安裝的話，全局調(diào)用得將它添加到環(huán)境。否則必須找到對(duì)應(yīng)路徑的文件調(diào)用才行。
全基因組分析實(shí)踐（參考：堿基礦工）
參考：堿基礦工從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上） 前言 由于人類基因組數(shù)據(jù)過大（我的小小服務(wù)器也只有50...
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氣泡圖用R，clusterprofile 包可以畫。hsa 是人類，出現(xiàn)KO 可能是有問題吧。另外，其實(shí)富集分析直接用上面那個(gè)包也可以做，非常方便
使用Metascape進(jìn)行GO及KEGG分析
參考： https://www.bilibili.com/video/BV1K741127FK/?spm_id_from=333.788.videocard.1部分圖片來源于...
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DALS017-高維數(shù)據(jù)推斷2-統(tǒng)計(jì)原理
title: DALS017-高維數(shù)據(jù)推斷2-統(tǒng)計(jì)原理date: 2019-08-17 12:0:00type: "tags"tags: 高維數(shù)據(jù)categories: Da...
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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OSCA單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析筆記-13、Multi-sample comparison對(duì)應(yīng)原版教程第14章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html[http://bioconductor....
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測序原理可以慢慢消化
基因測序技術(shù)總結(jié)
參考: 從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序數(shù)據(jù)分析：第1節(jié) 測序技術(shù)作者：堿基礦工參考：【陳巍學(xué)基因】視頻1：Illumina測序化學(xué)原理 前言 什么是全基因組測序？ 全基因組測序...
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只是搬運(yùn)知識(shí)點(diǎn)罷了
基因測序技術(shù)總結(jié)
參考: 從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序數(shù)據(jù)分析：第1節(jié) 測序技術(shù)作者：堿基礦工參考：【陳巍學(xué)基因】視頻1：Illumina測序化學(xué)原理 前言 什么是全基因組測序？ 全基因組測序...
