二陽了，不舒服。 最近忙于單細(xì)胞空間的教學(xué)課程，所以比較忙，大家感興趣可以去B站看一看。 昨天收到了一個(gè)消息，說我的做法讓生信培訓(xùn)公司覺得更卷了，我也只是表示，我也是無奈之舉...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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人生樂章
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NetAct代碼實(shí)操之單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子分析的新時(shí)代
前言 Immugent在之前的一篇推文；NetAct:利用基因活性構(gòu)建核心轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
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一個(gè)輕量級(jí)繪制熱圖的R包-HeatmapR
目前R中繪制熱圖的方式有很多，常用的如pheatmap、ComplexHeatmap包等，這里再給大家介紹一個(gè)輕量級(jí)的R包-HeatmapR包，即無需過多的前期數(shù)據(jù)處理，可同...
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“我不想24歲了，還花家里的錢”
今天接到一個(gè)小姑娘的咨詢，她問我的公眾號(hào)有沒有兼職可以提供，她可以做一些簡(jiǎn)單的下游分析賺點(diǎn)外快。 我說沒有呀。 科研服務(wù)是個(gè)苦差事 其實(shí)倒是經(jīng)常有一些讀者來求助，想要找我們做...
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KEGG通路的從屬/注釋信息如何獲取
富集分析經(jīng)常做，之前只知道GO term有從上到下的層次關(guān)系，今天才知道KEGG pathway也有類似的分層關(guān)系。 起因是我準(zhǔn)備更新一下自己的kegg富集結(jié)果展示圖，之前一...
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單細(xì)胞密度散點(diǎn)圖的繪制單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組之cellranger探索——1.安裝
實(shí)驗(yàn)室新服務(wù)器需要安裝cellranger，發(fā)現(xiàn)最新版（3.1.0）與舊版（1.2.0）有點(diǎn)差別，故整理流程如下： 1. 下載安裝 1.1下載地址 1.2 安裝指南 1.2....
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析之?dāng)M時(shí)序分析簡(jiǎn)介鑒定好細(xì)胞類型后，我們還可以對(duì)其進(jìn)行一些功能性分析，如擬時(shí)序分析和SCENIC分析，對(duì)細(xì)胞的生物學(xué)意義進(jìn)行一定程度上的挖掘。本期小編主要為大家介紹擬時(shí)序分析（Pseudoti...
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用Seurat做RNA Velocity安裝加載相應(yīng)的包 If you don't have velocyto's example mouse bone marrow dataset, download with ...
