Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號為KPGP-00001的數(shù)據(jù)。 先說一下KPGP吧，中文名叫韓國個人基因組計...
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WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
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2020-06-06-驅(qū)動基因背景 腫瘤基因組學(xué)目前面臨的挑戰(zhàn)之一是將腫瘤形成過程中所涉及的基因組變化（即驅(qū)動因素）與對癌細(xì)胞沒有任何益處的基因組區(qū)分開來。癌癥形成的過程中驅(qū)動基因（即那些帶有驅(qū)動因子變化...
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推薦一份很棒的R語言學(xué)習(xí)參考資料最近在用R語言算一個數(shù)據(jù)量相對比較大的數(shù)據(jù)集，掛在服務(wù)器上運行了一周也沒有得到結(jié)果，然后服務(wù)器突然死機(jī)了，一周的時間就白白浪費了。之前也聽說過R語言的運行速度相對比較慢，但是...
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TCGA和GEO套路文章解說文章，重在研究思路。有好的思路，才能有精彩的故事。很多時候，我們想找一個好點子，比如性狀，疾病相關(guān)的關(guān)鍵分子，需要設(shè)計實驗，做大量的分子篩選的工作，對于土豪實驗室可以可以大把...
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NGS基因檢測Panel的探針設(shè)計背景 目前市面上的腫瘤靶向用藥基因檢測Panel已非常常見，除了直觀層面的gene種類、數(shù)目、捕獲建庫方法的不同外，對于腫瘤panel， 探針定制之初相關(guān)的MSI位點、...
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R數(shù)據(jù)可視化8:金字塔圖和偏差圖其實圖形的基本組成都很簡單，無非就是點、線、矩形、圓圈等，但是稍作改變就會變成完全不同的圖。就好像PCA圖和火山圖一樣，本質(zhì)都是點圖。今天我們來講一講條形圖的變形。 化妝后“...
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R語言一鍵制作Table 1，就是這么簡單！
轉(zhuǎn)自醫(yī)學(xué)方 2019-07-4 Alexander 流行病學(xué)或者醫(yī)學(xué)論文中，對研究對象基本情況的描述通常以表格的形式進(jìn)行，并且放在結(jié)果部分的開頭，即Table 1，主要內(nèi)容是...
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寫給肖先生—致2周年打發(fā)掉剛剛睡醒，探頭探腦窺視我的肖先生，嘴角忍不住的上揚，心里滿滿當(dāng)當(dāng)都是幸福和滿足。 肖先生，21天后是你29歲生日，好巧，也是我30歲生日，我們戀愛兩周年紀(jì)念日（在我寫甜...
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2019意猶未盡的基因組可視化IGV（一）劉小澤寫于19.6.8之前最開始學(xué)習(xí)IGV的時候?qū)戇^兩篇推文，當(dāng)時簡單做了了解，但有朋友說意猶未盡，嗯我也這么覺得，總覺得還是學(xué)的不夠。推薦閱讀：https://github...
