HPA數(shù)據(jù)庫全稱The human protein atlas，即人類蛋白圖譜，里面有關(guān)于蛋白研究的許多信息，如蛋白細(xì)胞內(nèi)定位、在人體組織的表達(dá)情況，在腫瘤組織的表達(dá)情況等，...
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HPA數(shù)據(jù)庫更新腦圖譜、血液圖譜與代謝圖譜 -
都挺好的，看哪個(gè)方便吧
各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)（二）
各位小伙伴們大家好，今天是我們的系列推文“各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)”第二篇，今天介紹的主要內(nèi)容有：正態(tài)性檢驗(yàn)、方差齊性檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)、近似t檢驗(yàn)。 t檢驗(yàn) 此處選用的數(shù)據(jù)集仍是R...
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新版PubMed正式上線不知不覺，那個(gè)我們熟悉的舊版PubMed成功完成了他的歷史使命，正式退役。 新的界面乍一看比原來簡潔不少，那這個(gè)新版究竟如何使用呢？讓我們繼續(xù)往下看。 如圖所示，我們常用的功...
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免疫浸潤進(jìn)入2.0時(shí)代很久沒有做個(gè)免疫浸潤的分析了，轉(zhuǎn)眼間，兩大主流免疫浸潤工具都發(fā)布了2.0版本，CIERSORT更新為CIERSORTx，timer更新為timer2.0。 接下來，小伙伴們就...
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R語言統(tǒng)計(jì)系列第13篇-K-M生存曲線與logrank檢驗(yàn)今天是各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)的第13期，我們主要介紹R語言統(tǒng)計(jì)系列第13篇-K-M生存曲線與logrank檢驗(yàn)。 ### 生存分析 生存分析是將事件的結(jié)果和出現(xiàn)這一結(jié)果經(jīng)歷的...
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R語言統(tǒng)計(jì)系列第12篇-泊松回歸今天是各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)的第12期，我們主要介紹泊松回歸。 泊松回歸 計(jì)數(shù)型，如某地區(qū)某年發(fā)生腫瘤患者的人數(shù)等，常用泊松回歸，假設(shè)因變量Y服從泊松分布。 此處分析的是ro...
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R語言統(tǒng)計(jì)系列第11篇-Logistic回歸
今天是各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)的第11期，我們主要介紹Logistic回歸。Logistic回歸屬于廣義線性回歸，因此我們從廣義線性回歸講起。 廣義線性回歸 線性回歸模型要求因...
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統(tǒng)計(jì)（十）_自助法對(duì)于正態(tài)分布或其他已知分布的數(shù)據(jù)，有相應(yīng)的假設(shè)檢驗(yàn)與置信區(qū)間的計(jì)算方法，但是當(dāng)數(shù)據(jù)抽樣自未知或混合分布、樣本量過小、存在離群點(diǎn)、基于理論分布設(shè)計(jì)合適的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)過于復(fù)雜且數(shù)學(xué)上...
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統(tǒng)計(jì)（九）_置換檢驗(yàn)
對(duì)于正態(tài)分布或其他已知分布的數(shù)據(jù)，有相應(yīng)的假設(shè)檢驗(yàn)與置信區(qū)間的計(jì)算方法，但是當(dāng)數(shù)據(jù)抽樣自未知或混合分布、樣本量過小、存在離群點(diǎn)、基于理論分布設(shè)計(jì)合適的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)過于復(fù)雜且數(shù)學(xué)上...
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重復(fù)cell文章的圖在上次的推文中，我們介紹了腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞呈現(xiàn)出一種M1和M2亞型的混合狀態(tài)，有小伙伴要問了，這個(gè)結(jié)論真的是一種普遍規(guī)律嗎？會(huì)不會(huì)是一種偶然現(xiàn)象？ 的確，如果你是做基礎(chǔ)研究的...
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各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)（八）今天是各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)的第八期，我們主要介紹選擇“最佳”回歸模型與深層次分析。 選擇“最佳”回歸模型 當(dāng)我們構(gòu)建回歸方程時(shí)，我們一方面需要考慮是否去除不顯著的變量、是否...
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各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)（七）今天是各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)的第七期，我們主要介紹多重共線性、異常觀察值的分析和回歸模型改進(jìn)措施。 多重共線性 多重共線性是指線性回歸模型中的解釋變量之間由于存在強(qiáng)相關(guān)關(guān)系而...
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各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)（六）今天是各類統(tǒng)計(jì)方法R語言實(shí)現(xiàn)的第六期，我們主要介紹多元線性回歸、回歸診斷。 多元線性回歸 多元線性回歸指的是用多個(gè)自變量預(yù)測一個(gè)因變量，且自變量與因變量之間為線性關(guān)系，在分析...
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R語言統(tǒng)計(jì)系列匯總目錄
轉(zhuǎn)眼間，我們的R語言統(tǒng)計(jì)系列已經(jīng)經(jīng)歷的10期，我們從統(tǒng)計(jì)學(xué)最基礎(chǔ)的統(tǒng)計(jì)描述講到置換檢驗(yàn)和自主法等內(nèi)容，算是完成了統(tǒng)計(jì)的入門。 在這篇推文里，我一方面將匯總歸納之前的10期推文...
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挖掘GEO單細(xì)胞數(shù)據(jù)能發(fā)表5分文章？本文題為Systematic expression analysis of ligand-receptor pairs reveals important cell-to-c...
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單細(xì)胞測序識(shí)別乳腺癌異質(zhì)性和免疫細(xì)胞譜今天跟大家分享的是發(fā)表在NATURE COMMUNICATIONS雜志上的一則一篇文章：Single-cell RNA-seq enables comprehensive t...