轉(zhuǎn)錄因子(Transcription Factors, TFs)指能夠以序列特異性方式結(jié)合DNA并且調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子通過識(shí)別特定的DNA序列來控制染色質(zhì)和轉(zhuǎn)錄,以形...
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在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中一個(gè)重要的方面就是定義聚類得來的cluster,一個(gè)思考的方向就是根據(jù)marker基因來定義cluster的細(xì)胞類型(cell type)。怎樣才能建立c...
題外話:Python中可通過Lib目錄下的idlelib子目錄下的idle.pyw或者idle.py進(jìn)入Python的IDLE界面 DNA中的基因可以分為編碼區(qū)和非編碼區(qū),編...
說明:僅根據(jù)官網(wǎng)指南加個(gè)人理解,目前官網(wǎng)上發(fā)布了3.0版本的指南,下面內(nèi)容是2.4版本,內(nèi)容上有些許出入。 整合分析的目的: 1. 鑒定在兩種數(shù)據(jù)集中都存在的細(xì)胞類型2. 得...
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自己平常在用R/Rstudio本地處理數(shù)據(jù)或者畫圖時(shí),因數(shù)據(jù)量太大(電腦性能太差)而經(jīng)??ǖ牟恍?。前些天突然了解到原來在服務(wù)器上也可以裝Rstudio,其與本地電腦圖形化的界...
FastQC的基本介紹: FastQC是一款基于Java的軟件,它可以快速地對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估,其官網(wǎng)為:http://www.bioinformatics.babrah...
概要 本文主要討論Seurat對(duì)象導(dǎo)入到Monocle中直接進(jìn)行分析的可行性,分兩種情況:①經(jīng)過數(shù)據(jù)清洗、標(biāo)準(zhǔn)化和聚類的Seurat對(duì)象導(dǎo)入②未經(jīng)過任何處理的Seurat對(duì)象...