轉(zhuǎn)錄因子(Transcription Factors, TFs)指能夠以序列特異性方式結(jié)合DNA并且調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子通過識別特定的DNA序列來控制染色質(zhì)和轉(zhuǎn)錄，以形...
發(fā)簡信
IP屬地：陜西
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Cell重磅綜述:關(guān)于人類轉(zhuǎn)錄因子,你想知道的都在這
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HZAU植科院農(nóng)學(xué)本科畢業(yè)生<br>HZAU信息學(xué)院生信專業(yè)碩士畢業(yè)生<br>目前就職于國內(nèi)某知名藥企數(shù)據(jù)分析崗位<br>主要擅長SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>對爬蟲、網(wǎng)站搭建感興趣<br><br>歡迎一起討論呀~<br>簡書不定時(shí)查看，有需要?dú)g迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
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single cell marker 基因數(shù)據(jù)庫在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中一個(gè)重要的方面就是定義聚類得來的cluster，一個(gè)思考的方向就是根據(jù)marker基因來定義cluster的細(xì)胞類型（cell type）。怎樣才能建立c...
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生信初學(xué)者--小瑜
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exon,intron,CDs,UTR學(xué)習(xí)題外話：Python中可通過Lib目錄下的idlelib子目錄下的idle.pyw或者idle.py進(jìn)入Python的IDLE界面 DNA中的基因可以分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)，編...
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生信坑底躺著不動的男人<br>簡書不常在，有問題可私信
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@njmujjc 謝謝！應(yīng)該就是這個(gè)問題??
10xgenomics做scRNA-seq
PATH=/media/pc/disk2/jjc/2018-9-5-scRNA-seq/cellranger-2.2.0:$PATH ##fastq文件名字要改為SRR623...
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Seurat：Integrating stimulated vs. control PBMC datasets to learn cell-type specific responses說明：僅根據(jù)官網(wǎng)指南加個(gè)人理解，目前官網(wǎng)上發(fā)布了3.0版本的指南，下面內(nèi)容是2.4版本，內(nèi)容上有些許出入。 整合分析的目的： 1. 鑒定在兩種數(shù)據(jù)集中都存在的細(xì)胞類型2. 得...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.itdecent.cn/p...
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你好，我下載的原始數(shù)據(jù)也是SRR6230316，請問你拆成fastq文件時(shí)怎么拆成10×genomics的標(biāo)準(zhǔn)格式??？我用--split-files還是只有一個(gè)fastq文件。
10xgenomics做scRNA-seq
PATH=/media/pc/disk2/jjc/2018-9-5-scRNA-seq/cellranger-2.2.0:$PATH ##fastq文件名字要改為SRR623...
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@周運(yùn)來就是我 我也是用的--split-files，但是拆出來只有一個(gè)fastq文件，是因?yàn)樽髡呱蟼鲾?shù)據(jù)不全嗎
10X單細(xì)胞測序分析軟件:Cell ranger
單細(xì)胞測序有著漫長的過去，卻只有短暫的歷史---誰說的！ 說她漫長是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了，說她段短暫是因?yàn)獒槍渭?xì)胞的分析工具越來越有意義開發(fā)周期卻越來越短。一般生物...
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請問從NCBI上下載的sra原始數(shù)據(jù)拆分成fastq文件怎么能適合進(jìn)入cellranger呢？用fastq-dump拆分后只有一個(gè)文件夾（參數(shù)改過也沒用），文獻(xiàn)里顯示是10×genomics的數(shù)據(jù)。
10X單細(xì)胞測序分析軟件:Cell ranger
單細(xì)胞測序有著漫長的過去，卻只有短暫的歷史---誰說的！ 說她漫長是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了，說她段短暫是因?yàn)獒槍渭?xì)胞的分析工具越來越有意義開發(fā)周期卻越來越短。一般生物...
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服務(wù)器上Rstudio的安裝(Rstudio-server)
自己平常在用R/Rstudio本地處理數(shù)據(jù)或者畫圖時(shí)，因數(shù)據(jù)量太大（電腦性能太差）而經(jīng)?？ǖ牟恍?。前些天突然了解到原來在服務(wù)器上也可以裝Rstudio，其與本地電腦圖形化的界...
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你好，如果沒有管理員權(quán)限應(yīng)該怎么安裝服務(wù)器版Rstudio呢？
安裝服務(wù)器版的Rstudio
Rstudio-server：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/ 安裝方法參考：https:/...
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小劉哥，農(nóng)民、生信民工、程序員、理想主義者
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優(yōu)美勝于丑陋，明了勝于晦澀，簡潔勝于復(fù)雜。<br>復(fù)雜勝于凌亂，扁平勝于嵌套，間隔勝于緊湊。
