更新于2020.10.27 二代測序方式分為三種：single read 單端測序paired-end read 雙端測序mate-pair read 配對測序 雖然有三種方...
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WGS分析筆記（1）—— 原始數(shù)據(jù)以及質(zhì)控 -
GWAS分析-說人話（22）-"最終章"
前言 “天下沒有不散的筵席”～ 正如開章所說“這個年代，誰?還有人做GWAS啊？！” 也沒有想到這個系列是最受歡迎的， 親們所看到1-21章操作出來的文章，今天的狀態(tài)更新了 ...
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GWAS分析-說人話（21）-上位效應(yīng)（epistasis）分析
前言 今天說一下如何“上位”～ 1.大神橙子牛奶糖已經(jīng)寫得很清楚了，不多寫： https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.ht...
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GWAS分析-說人話（14）- 如何查看SNP的基因型
前言 這年頭，誰還TM的做GWAS～ 今天導(dǎo)師不是想和你看流星雨， 是想和你看看他感興趣SNPs在某個亞組數(shù)據(jù)中的基因型....... 怎么辦？ I have 一堆SNPs，...
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SNP功能注釋常用數(shù)據(jù)庫1、GWAS4D 網(wǎng)址：http://mulinlab.tmu.edu.cn/gwas4d 2、SNPnexus 網(wǎng)址：https://www.snp-nexus.org/i...
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SNP位點尋找流程——傻瓜版
本人通過無數(shù)個網(wǎng)上文章的指導(dǎo)，無數(shù)個蘿卜的坑，終于摸索出了一整套完整的、傻瓜式的尋找全基因組的SNP實操流程。 僅以此文紀(jì)念我這倆個月的努力。 首先獲得序列。序列的這一塊我是...
