加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測(cè)試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類(lèi)后的順序輸出
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：安徽
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snakemake使用筆記
snakemake是一個(gè)用來(lái)編寫(xiě)任務(wù)流程的工具，用python編寫(xiě)的，因此其執(zhí)行的流程腳本也比較通俗易懂，易于理解。 一、從一個(gè)簡(jiǎn)單的例子開(kāi)始 1、安裝snakemake 安...
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【Bioconductor系列】如何用Bioconductor對(duì)基因組注釋
這一次，我們來(lái)聊聊基因組注釋。首先問(wèn)自己一個(gè)問(wèn)題，為什么要進(jìn)行基因注釋。就我目前而言，它用來(lái)解決如下問(wèn)題： 在mapping-by-sequencing的時(shí)候，我找到了一些可...
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使用R語(yǔ)言進(jìn)行卡方檢驗(yàn)（chi-square test）文|程瑞林（山東大學(xué)第二醫(yī)院足踝外科）來(lái)源|（微信公眾號(hào)）云中瑞麟（ID：ruilinfly） 瑞麟導(dǎo)讀：對(duì)于計(jì)量資料，臨床醫(yī)學(xué)研究中常用的統(tǒng)計(jì)分析方法是t檢驗(yàn)；而對(duì)于計(jì)數(shù)資...
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繪制差異基因kegg注釋圖
“差異基因kegg注釋圖”是轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的重要組成部分，能夠幫助大家了解差異基因分屬于哪些代謝通路，文章中如果能夠插入下面這類(lèi)圖來(lái)說(shuō)明樣品間的差異，一定會(huì)為你的文章增色不少...
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GTF/GFF文件的差異及其相互轉(zhuǎn)換我們?cè)谧錾锓治龅臅r(shí)候，經(jīng)常會(huì)碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注釋文件。他們有著相似的名字，甚至連內(nèi)容都極為相似~那么，他們究竟差在哪里呢？ GFF全稱(chēng)為general ...
